Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUDCQ9Y266 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms