Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSG0

PRADC1, Protease-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1Q9BSG0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRADC1Q9BSG0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRADC1Q9BSG0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms