Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GATAD2BQ8WXI9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GATAD2BQ8WXI9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GATAD2BQ8WXI9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GATAD2BQ8WXI9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GATAD2BQ8WXI9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GATAD2BQ8WXI9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GATAD2BQ8WXI9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GATAD2BQ8WXI9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GATAD2BQ8WXI9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GATAD2BQ8WXI9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GATAD2BQ8WXI9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GATAD2BQ8WXI9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GATAD2BQ8WXI9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GATAD2BQ8WXI9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GATAD2BQ8WXI9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GATAD2BQ8WXI9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GATAD2BQ8WXI9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GATAD2BQ8WXI9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GATAD2BQ8WXI9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GATAD2BQ8WXI9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GATAD2BQ8WXI9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GATAD2BQ8WXI9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GATAD2BQ8WXI9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GATAD2BQ8WXI9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms