Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
GATAD2BQ8WXI9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GATAD2BQ8WXI9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GATAD2BQ8WXI9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GATAD2BQ8WXI9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
GATAD2BQ8WXI9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GATAD2BQ8WXI9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GATAD2BQ8WXI9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
GATAD2BQ8WXI9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GATAD2BQ8WXI9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GATAD2BQ8WXI9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GATAD2BQ8WXI9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GATAD2BQ8WXI9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GATAD2BQ8WXI9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GATAD2BQ8WXI9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GATAD2BQ8WXI9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GATAD2BQ8WXI9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GATAD2BQ8WXI9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GATAD2BQ8WXI9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GATAD2BQ8WXI9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GATAD2BQ8WXI9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GATAD2BQ8WXI9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GATAD2BQ8WXI9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GATAD2BQ8WXI9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GATAD2BQ8WXI9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GATAD2BQ8WXI9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GATAD2BQ8WXI9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GATAD2BQ8WXI9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GATAD2BQ8WXI9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GATAD2BQ8WXI9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GATAD2BQ8WXI9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GATAD2BQ8WXI9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GATAD2BQ8WXI9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GATAD2BQ8WXI9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GATAD2BQ8WXI9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GATAD2BQ8WXI9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GATAD2BQ8WXI9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GATAD2BQ8WXI9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GATAD2BQ8WXI9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GATAD2BQ8WXI9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GATAD2BQ8WXI9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GATAD2BQ8WXI9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GATAD2BQ8WXI9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GATAD2BQ8WXI9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GATAD2BQ8WXI9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GATAD2BQ8WXI9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GATAD2BQ8WXI9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GATAD2BQ8WXI9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GATAD2BQ8WXI9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GATAD2BQ8WXI9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GATAD2BQ8WXI9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GATAD2BQ8WXI9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GATAD2BQ8WXI9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GATAD2BQ8WXI9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GATAD2BQ8WXI9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GATAD2BQ8WXI9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GATAD2BQ8WXI9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GATAD2BQ8WXI9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GATAD2BQ8WXI9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GATAD2BQ8WXI9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GATAD2BQ8WXI9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GATAD2BQ8WXI9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GATAD2BQ8WXI9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GATAD2BQ8WXI9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GATAD2BQ8WXI9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GATAD2BQ8WXI9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GATAD2BQ8WXI9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GATAD2BQ8WXI9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GATAD2BQ8WXI9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GATAD2BQ8WXI9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GATAD2BQ8WXI9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GATAD2BQ8WXI9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GATAD2BQ8WXI9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GATAD2BQ8WXI9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GATAD2BQ8WXI9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GATAD2BQ8WXI9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GATAD2BQ8WXI9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GATAD2BQ8WXI9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GATAD2BQ8WXI9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GATAD2BQ8WXI9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GATAD2BQ8WXI9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GATAD2BQ8WXI9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GATAD2BQ8WXI9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GATAD2BQ8WXI9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GATAD2BQ8WXI9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GATAD2BQ8WXI9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GATAD2BQ8WXI9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GATAD2BQ8WXI9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GATAD2BQ8WXI9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GATAD2BQ8WXI9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GATAD2BQ8WXI9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GATAD2BQ8WXI9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GATAD2BQ8WXI9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GATAD2BQ8WXI9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GATAD2BQ8WXI9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GATAD2BQ8WXI9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GATAD2BQ8WXI9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GATAD2BQ8WXI9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GATAD2BQ8WXI9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GATAD2BQ8WXI9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms