Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIP10Q15642 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIP10Q15642 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIP10Q15642 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIP10Q15642 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIP10Q15642 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIP10Q15642 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIP10Q15642 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIP10Q15642 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIP10Q15642 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRIP10Q15642 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP10Q15642 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP10Q15642 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP10Q15642 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP10Q15642 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP10Q15642 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP10Q15642 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIP10Q15642 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms