Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 UBE2L3-204ENST00000545681 2932 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.421e-9■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 UBE2L3-201ENST00000342192 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.531e-9■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 UBE2L3-202ENST00000458578 3007 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.641e-9■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 TPR-208ENST00000492973 453 ntTSL 26.82□□□□□ -1.321e-17■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 CDC37-203ENST00000588869 966 ntTSL 517.92■□□□□ 0.463e-9■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 BRD3-205ENST00000473349 761 ntTSL 310.18□□□□□ -0.781e-7■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.12e-6■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 EIF3J-207ENST00000558353 1024 ntTSL 55.93□□□□□ -1.466e-23■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 EIF3J-205ENST00000558053 463 ntTSL 25.25□□□□□ -1.576e-23■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 EIF3J-204ENST00000536248 533 ntTSL 25.23□□□□□ -1.576e-23■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 SSR1-208ENST00000483409 570 ntTSL 413.51□□□□□ -0.252e-9■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 SSR1-203ENST00000462112 1094 ntTSL 4 BASIC8.25□□□□□ -1.092e-9■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 SSR1-209ENST00000488834 585 ntTSL 45.29□□□□□ -1.562e-9■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 MAP4K4-218ENST00000498066 1017 ntTSL 213.44□□□□□ -0.263e-8■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.42e-6■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.482e-6■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.435e-8■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 AKAP17A-203ENST00000474361 3232 ntTSL 1 (best)17.71■□□□□ 0.435e-8■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 ANKHD1-207ENST00000421134 4814 ntTSL 517.76■□□□□ 0.431e-7■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.061e-7■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.041e-7■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.231e-7■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 NOP58-206ENST00000478508 599 ntTSL 26.05□□□□□ -1.446e-35■■□□□ 14.3
PUM1Q14671 FAM13A-220ENST00000513837 2590 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.881e-6■■□□□ 14.2
PUM1Q14671 FAM13A-212ENST00000508369 3169 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.971e-6■■□□□ 14.2
PUM1Q14671 FAM13A-202ENST00000395002 4945 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.11e-6■■□□□ 14.2
PUM1Q14671 FAM13A-201ENST00000264344 5858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.141e-6■■□□□ 14.2
PUM1Q14671 FAM13A-218ENST00000511976 3579 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.161e-6■■□□□ 14.2
PUM1Q14671 FAM13A-205ENST00000503556 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.191e-6■■□□□ 14.2
PUM1Q14671 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.192e-9■■□□□ 14.2
PUM1Q14671 RAN-205ENST00000477395 762 ntTSL 517.02■□□□□ 0.323e-7■■□□□ 14.2
PUM1Q14671 RAN-207ENST00000536606 572 ntTSL 311.82□□□□□ -0.523e-7■■□□□ 14.2
PUM1Q14671 RAN-206ENST00000535090 657 ntTSL 55.02□□□□□ -1.613e-7■■□□□ 14.2
PUM1Q14671 SRRM1-216ENST00000489130 513 ntTSL 213.21□□□□□ -0.299e-11■■□□□ 14.2
PUM1Q14671 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.425e-10■■□□□ 14.2
PUM1Q14671 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.515e-10■■□□□ 14.2
PUM1Q14671 CCDC12-212ENST00000605358 402 ntTSL 519.49■□□□□ 0.715e-8■■□□□ 14.2
PUM1Q14671 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.023e-10■■□□□ 14.2
PUM1Q14671 SLC6A8-209ENST00000476466 470 ntTSL 314.64□□□□□ -0.077e-10■■□□□ 14.2
PUM1Q14671 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.227e-7■■□□□ 14.2
PUM1Q14671 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.997e-7■■□□□ 14.2
PUM1Q14671 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.767e-7■■□□□ 14.2
PUM1Q14671 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.257e-7■■□□□ 14.2
PUM1Q14671 COMT-201ENST00000207636 1319 ntTSL 515.58■□□□□ 0.087e-7■■□□□ 14.2
PUM1Q14671 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.087e-7■■□□□ 14.2
PUM1Q14671 BCOR-201ENST00000342274 6390 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.83e-6■■□□□ 14.2
PUM1Q14671 BCOR-203ENST00000378455 6338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -13e-6■■□□□ 14.2
PUM1Q14671 ATG3-206ENST00000492886 639 ntTSL 314.9□□□□□ -0.028e-8■■□□□ 14.2
PUM1Q14671 CLNS1A-205ENST00000526009 747 ntTSL 38.5□□□□□ -1.054e-8■■□□□ 14.2
PUM1Q14671 CLNS1A-206ENST00000526761 415 ntTSL 37.35□□□□□ -1.234e-8■■□□□ 14.2
PUM1Q14671 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.416e-11■■□□□ 14.2
PUM1Q14671 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.326e-11■■□□□ 14.2
PUM1Q14671 CLASRP-202ENST00000391952 2213 ntTSL 1 (best)14.93□□□□□ -0.026e-11■■□□□ 14.2
PUM1Q14671 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.196e-11■■□□□ 14.2
PUM1Q14671 NCL-202ENST00000356936 890 ntTSL 317.79■□□□□ 0.442e-21■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 CKB-208ENST00000554426 775 ntTSL 529.24■■■□□ 2.274e-7■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.154e-7■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 CKB-204ENST00000553652 1239 ntTSL 518.74■□□□□ 0.594e-7■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 RBMX2-205ENST00000639890 871 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.491e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 RBMX2-201ENST00000305536 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.781e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 HNRNPM-213ENST00000600092 1086 ntTSL 219.27■□□□□ 0.686e-8■■□□□ 14.1
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PUM1Q14671 DNM1-210ENST00000625457 333 ntTSL 220.55■□□□□ 0.883e-11■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.153e-11■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.13e-11■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.263e-11■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.523e-11■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.161e-6■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 NOC2L-203ENST00000477976 4201 ntTSL 510.69□□□□□ -0.71e-6■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 MRPS5-203ENST00000461916 793 ntTSL 29.87□□□□□ -0.833e-6■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 EWSR1-205ENST00000360091 1289 ntTSL 520.62■□□□□ 0.893e-10■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.523e-10■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.413e-10■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 EWSR1-218ENST00000483629 1818 ntTSL 517.17■□□□□ 0.343e-10■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.263e-10■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.243e-10■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.213e-10■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 EWSR1-221ENST00000610553 2300 ntTSL 216.28■□□□□ 0.23e-10■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.173e-10■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 EWSR1-215ENST00000469669 2630 ntTSL 215.88■□□□□ 0.133e-10■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.083e-10■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 EWSR1-216ENST00000479135 7285 ntTSL 1 (best)11.02□□□□□ -0.653e-10■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 DDX42-212ENST00000581135 589 ntTSL 416.78■□□□□ 0.282e-6■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 MCM4-204ENST00000518382 366 ntTSL 34.97□□□□□ -1.616e-7■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.226e-7■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 LSM3-201ENST00000306024 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.784e-13■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 MRPS15-203ENST00000477040 533 ntTSL 26.36□□□□□ -1.391e-11■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 P4HB-206ENST00000471535 579 ntTSL 424.36■■□□□ 1.492e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 P4HB-205ENST00000467086 785 ntTSL 523.9■■□□□ 1.422e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.292e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.152e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.112e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 P4HB-204ENST00000466567 872 ntTSL 221.92■■□□□ 1.12e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 P4HB-219ENST00000574914 571 ntTSL 421.92■■□□□ 1.12e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 P4HB-224ENST00000576541 571 ntTSL 521.92■■□□□ 1.12e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.062e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.862e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 P4HB-221ENST00000576052 562 ntTSL 420.43■□□□□ 0.862e-8■■□□□ 14.1
PUM1Q14671 P4HB-217ENST00000573778 688 ntTSL 519.85■□□□□ 0.772e-8■■□□□ 14.1
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