Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63121 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63121 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63121 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63121 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63121 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63121 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63121 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63121 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63121 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63121 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63121 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63121 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63121 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63121 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63121 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63121 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63121 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERVK_113P63121 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HERVK_113P63121 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERVK_113P63121 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HERVK_113P63121 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
HERVK_113P63121 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERVK_113P63121 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERVK_113P63121 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERVK_113P63121 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERVK_113P63121 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERVK_113P63121 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HERVK_113P63121 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERVK_113P63121 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERVK_113P63121 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
HERVK_113P63121 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERVK_113P63121 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms