Protein–RNA interactions for Protein: Q14191

WRN, Werner syndrome ATP-dependent helicase, humanhuman

Predicted RBP eCLIP

Length 1,432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WRNQ14191 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.333e-6■■■■■ 28.5
WRNQ14191 MOK-219ENST00000521766 2736 ntTSL 229.53■■■□□ 2.323e-6■■■■■ 28.5
WRNQ14191 MOK-229ENST00000523485 2705 ntTSL 227.79■■■□□ 2.043e-6■■■■■ 28.5
WRNQ14191 MOK-207ENST00000518686 2897 ntTSL 224.36■■□□□ 1.493e-6■■■■■ 28.5
WRNQ14191 MOK-238ENST00000559838 643 ntTSL 322.75■■□□□ 1.233e-6■■■■■ 28.5
WRNQ14191 MOK-236ENST00000559138 2041 ntTSL 1 (best)20.88■□□□□ 0.933e-6■■■■■ 28.5
WRNQ14191 MOK-235ENST00000557823 635 ntTSL 319.32■□□□□ 0.683e-6■■■■■ 28.5
WRNQ14191 MOK-240ENST00000562292 735 ntTSL 519.22■□□□□ 0.673e-6■■■■■ 28.5
WRNQ14191 MOK-217ENST00000521388 770 ntTSL 513.91□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 28.5
WRNQ14191 MOK-231ENST00000524120 546 ntTSL 312.24□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 28.5
WRNQ14191 ZFPM1-202ENST00000562417 497 ntTSL 330.39■■■□□ 2.457e-7■■■■■ 28.5
WRNQ14191 CBFA2T3-204ENST00000563640 664 ntTSL 227.91■■■□□ 2.062e-6■■■■■ 28.4
WRNQ14191 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 28.4
WRNQ14191 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.312e-6■■■■■ 28.3
WRNQ14191 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 28.3
WRNQ14191 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.752e-6■■■■■ 28.3
WRNQ14191 CTBP1-214ENST00000514495 564 ntTSL 248.95■■■■■ 5.434e-8■■■■■ 27.9
WRNQ14191 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.171e-6■■■■■ 27.9
WRNQ14191 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.814e-8■■■■■ 27.9
WRNQ14191 MMP25-AS1-203ENST00000572427 560 ntTSL 338.31■■■■□ 3.721e-6■■■■■ 27.9
WRNQ14191 RER1-201ENST00000306256 695 ntTSL 536.58■■■■□ 3.454e-8■■■■■ 27.9
WRNQ14191 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.264e-8■■■■■ 27.9
WRNQ14191 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.144e-8■■■■■ 27.9
WRNQ14191 CTBP1-217ENST00000515399 985 ntTSL 334.2■■■■□ 3.064e-8■■■■■ 27.9
WRNQ14191 COG8-202ENST00000562595 2262 ntTSL 534.12■■■■□ 3.054e-8■■■■■ 27.9
WRNQ14191 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.041e-6■■■■■ 27.9
WRNQ14191 CTBP1-208ENST00000506180 843 ntTSL 532.59■■■□□ 2.814e-8■■■■■ 27.9
WRNQ14191 ARVCF-207ENST00000473551 2108 ntTSL 231.46■■■□□ 2.634e-8■■■■■ 27.9
WRNQ14191 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.394e-8■■■■■ 27.9
WRNQ14191 RER1-208ENST00000493207 686 ntTSL 229.18■■■□□ 2.264e-8■■■■■ 27.9
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WRNQ14191 CTBP1-212ENST00000513420 704 ntTSL 326.14■■□□□ 1.774e-8■■■■■ 27.9
WRNQ14191 CTBP1-213ENST00000514210 856 ntTSL 226.05■■□□□ 1.764e-8■■■■■ 27.9
WRNQ14191 MMP25-AS1-202ENST00000572222 410 ntTSL 325.83■■□□□ 1.731e-6■■■■■ 27.9
WRNQ14191 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.711e-6■■■■■ 27.9
WRNQ14191 COG8-203ENST00000564419 936 ntTSL 525.43■■□□□ 1.664e-8■■■■■ 27.9
WRNQ14191 TROVE2-209ENST00000460715 1474 ntTSL 325.19■■□□□ 1.624e-8■■■■■ 27.9
WRNQ14191 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.554e-8■■■■■ 27.9
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WRNQ14191 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.354e-8■■■■■ 27.9
WRNQ14191 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.284e-8■■■■■ 27.9
WRNQ14191 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.194e-8■■■■■ 27.9
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WRNQ14191 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.064e-8■■■■■ 27.9
WRNQ14191 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.844e-8■■■■■ 27.9
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WRNQ14191 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.034e-8■■■■■ 27.9
WRNQ14191 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.024e-8■■■■■ 27.9
WRNQ14191 MTHFR-204ENST00000376590 7094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.084e-8■■■■■ 27.9
WRNQ14191 PTPRVP-201ENST00000482597 3999 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 27.9
WRNQ14191 RER1-205ENST00000443438 540 ntTSL 214.09□□□□□ -0.154e-8■■■■■ 27.9
WRNQ14191 MTHFR-203ENST00000376585 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.194e-8■■■■■ 27.9
WRNQ14191 LYRM4-201ENST00000330636 7312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.751e-6■■■■■ 27.9
WRNQ14191 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.145e-7■■■■■ 27.7
WRNQ14191 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.745e-7■■■■■ 27.7
WRNQ14191 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.365e-7■■■■■ 27.7
WRNQ14191 TMEM259-205ENST00000586704 2538 ntTSL 528.42■■■□□ 2.145e-7■■■■■ 27.7
WRNQ14191 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.16□□□□□ -1.91e-323■■■■■ 27.3
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WRNQ14191 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.293e-6■■■■■ 27.2
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WRNQ14191 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.784e-10■■■■■ 27.2
WRNQ14191 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.913e-6■■■■■ 27
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WRNQ14191 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.683e-6■■■■□ 26.6
WRNQ14191 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.273e-6■■■■□ 26.6
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WRNQ14191 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.011e-6■■■■□ 26.4
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WRNQ14191 VEGFA-220ENST00000519767 970 ntTSL 1 (best)44.82■■■■■ 4.771e-6■■■■□ 26.4
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WRNQ14191 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.711e-6■■■■□ 26.4
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WRNQ14191 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.711e-6■■■■□ 26.4
WRNQ14191 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.711e-6■■■■□ 26.4
WRNQ14191 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.711e-6■■■■□ 26.4
WRNQ14191 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.711e-6■■■■□ 26.4
WRNQ14191 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.711e-6■■■■□ 26.4
WRNQ14191 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.361e-6■■■■□ 26.4
WRNQ14191 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.81e-6■■■■□ 26.4
WRNQ14191 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.631e-6■■■■□ 26.4
WRNQ14191 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.541e-6■■■■□ 26.4
WRNQ14191 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.81e-6■■■■□ 26.4
WRNQ14191 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.341e-6■■■■□ 26.4
WRNQ14191 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.161e-6■■■■□ 26.4
WRNQ14191 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.111e-6■■■■□ 26.4
WRNQ14191 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.111e-6■■■■□ 26.4
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