RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572427.1

MMP25-AS1-203, MMP25 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene MMP25-AS1, Length 560 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP25-AS1-203ENST00000572427 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.58■■■■■ 6.17
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MMP25-AS1-203ENST00000572427 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.67■■■■■ 4.9
MMP25-AS1-203ENST00000572427 NACADO15069 1562 aa45.39■■■■■ 4.86
MMP25-AS1-203ENST00000572427 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.22■■■■■ 4.83
MMP25-AS1-203ENST00000572427 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.84■■■■■ 4.77
MMP25-AS1-203ENST00000572427 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.7■■■■■ 4.75
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MMP25-AS1-203ENST00000572427 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.45■■■■■ 4.71
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MMP25-AS1-203ENST00000572427 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.22■■■■■ 4.67
MMP25-AS1-203ENST00000572427 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.82■■■■■ 4.6
MMP25-AS1-203ENST00000572427 SCRIBQ14160 1630 aa43.73■■■■■ 4.59
MMP25-AS1-203ENST00000572427 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.22■■■■■ 4.51
MMP25-AS1-203ENST00000572427 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.19■■■■■ 4.5
MMP25-AS1-203ENST00000572427 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.13■■■■■ 4.5
MMP25-AS1-203ENST00000572427 NCAPD3P42695 1498 aa41.9■■■■■ 4.3
MMP25-AS1-203ENST00000572427 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.78■■■■■ 4.28
MMP25-AS1-203ENST00000572427 SMARCA4P51532 1647 aa41.74■■■■■ 4.27
MMP25-AS1-203ENST00000572427 SMARCA2P51531 1590 aa41.71■■■■■ 4.27
MMP25-AS1-203ENST00000572427 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.62■■■■■ 4.25
MMP25-AS1-203ENST00000572427 HMGXB3Q12766 1538 aa41.6■■■■■ 4.25
MMP25-AS1-203ENST00000572427 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
MMP25-AS1-203ENST00000572427 ERCC6Q03468 1493 aa41.4■■■■■ 4.22
MMP25-AS1-203ENST00000572427 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.35■■■■■ 4.21
MMP25-AS1-203ENST00000572427 CUX2O14529 1486 aa41.26■■■■■ 4.2
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MMP25-AS1-203ENST00000572427 NESP48681 1621 aa41.11■■■■■ 4.17
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MMP25-AS1-203ENST00000572427 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.93■■■■■ 4.14
MMP25-AS1-203ENST00000572427 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.76■■■■■ 4.11
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MMP25-AS1-203ENST00000572427 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
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MMP25-AS1-203ENST00000572427 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.56■■■■■ 4.08
MMP25-AS1-203ENST00000572427 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
MMP25-AS1-203ENST00000572427 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.33■■■■■ 4.05
MMP25-AS1-203ENST00000572427 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
MMP25-AS1-203ENST00000572427 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.22■■■■■ 4.03
MMP25-AS1-203ENST00000572427 WDR62O43379 1518 aa40.21■■■■■ 4.03
MMP25-AS1-203ENST00000572427 CFTRP13569 1480 aa40.19■■■■■ 4.03
MMP25-AS1-203ENST00000572427 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.18■■■■■ 4.02
MMP25-AS1-203ENST00000572427 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.83■■■■□ 3.97
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MMP25-AS1-203ENST00000572427 OSCARQ8IYS5 282 aa39.42■■■■□ 3.9
MMP25-AS1-203ENST00000572427 ABCC8Q09428 1581 aa39.42■■■■□ 3.9
MMP25-AS1-203ENST00000572427 TOPBP1Q92547 1522 aa39.4■■■■□ 3.9
MMP25-AS1-203ENST00000572427 TRIM41Q8WV44 630 aa39.31■■■■□ 3.88
MMP25-AS1-203ENST00000572427 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.29■■■■□ 3.88
MMP25-AS1-203ENST00000572427 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.26■■■■□ 3.88
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MMP25-AS1-203ENST00000572427 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.02■■■■□ 3.84
MMP25-AS1-203ENST00000572427 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39■■■■□ 3.83
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MMP25-AS1-203ENST00000572427 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.85■■■■□ 3.81
MMP25-AS1-203ENST00000572427 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.84■■■■□ 3.81
MMP25-AS1-203ENST00000572427 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.79■■■■□ 3.8
MMP25-AS1-203ENST00000572427 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.78■■■■□ 3.8
MMP25-AS1-203ENST00000572427 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.78■■■■□ 3.8
MMP25-AS1-203ENST00000572427 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.78■■■■□ 3.8
MMP25-AS1-203ENST00000572427 CUX1P39880 1505 aa38.76■■■■□ 3.8
MMP25-AS1-203ENST00000572427 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.76■■■■□ 3.8
MMP25-AS1-203ENST00000572427 FBLN2P98095 1184 aa38.74■■■■□ 3.79
MMP25-AS1-203ENST00000572427 ARHGEF11O15085 1522 aa38.72■■■■□ 3.79
MMP25-AS1-203ENST00000572427 WDR97A6NE52 1622 aa38.71■■■■□ 3.79
MMP25-AS1-203ENST00000572427 CHD1O14646 1710 aa38.69■■■■□ 3.78
MMP25-AS1-203ENST00000572427 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.58■■■■□ 3.77
MMP25-AS1-203ENST00000572427 GRIN2BQ13224 1484 aa38.54■■■■□ 3.76
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MMP25-AS1-203ENST00000572427 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.5■■■■□ 3.75
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MMP25-AS1-203ENST00000572427 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.41■■■■□ 3.74
MMP25-AS1-203ENST00000572427 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.38■■■■□ 3.74
MMP25-AS1-203ENST00000572427 SYNJ2O15056 1496 aa38.38■■■■□ 3.73
MMP25-AS1-203ENST00000572427 SYNJ1O43426 1573 aa38.36■■■■□ 3.73
MMP25-AS1-203ENST00000572427 ARAP1Q96P48 1450 aa38.33■■■■□ 3.73
MMP25-AS1-203ENST00000572427 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.31■■■■□ 3.721e-6■■■■■ 27.9
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MMP25-AS1-203ENST00000572427 PBRM1Q86U86 1689 aa38.29■■■■□ 3.72
MMP25-AS1-203ENST00000572427 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.27■■■■□ 3.72
MMP25-AS1-203ENST00000572427 TOP2BQ02880 1626 aa38.2■■■■□ 3.7
MMP25-AS1-203ENST00000572427 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.17■■■■□ 3.7
MMP25-AS1-203ENST00000572427 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.02■■■■□ 3.68
MMP25-AS1-203ENST00000572427 GRIN2AQ12879 1464 aa38.02■■■■□ 3.68
MMP25-AS1-203ENST00000572427 ADAMTS12P58397 1594 aa37.97■■■■□ 3.67
MMP25-AS1-203ENST00000572427 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.95■■■■□ 3.67
MMP25-AS1-203ENST00000572427 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.92■■■■□ 3.66
MMP25-AS1-203ENST00000572427 NUP160Q12769 1436 aa37.87■■■■□ 3.65
MMP25-AS1-203ENST00000572427 CEP170Q5SW79 1584 aa37.81■■■■□ 3.64
MMP25-AS1-203ENST00000572427 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.66■■■■□ 3.62
MMP25-AS1-203ENST00000572427 SHROOM2Q13796 1616 aa37.64■■■■□ 3.62
MMP25-AS1-203ENST00000572427 KIF27Q86VH2 1401 aa37.53■■■■□ 3.6
MMP25-AS1-203ENST00000572427 JPH4Q96JJ6 628 aa37.52■■■■□ 3.6
MMP25-AS1-203ENST00000572427 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.52■■■■□ 3.6
MMP25-AS1-203ENST00000572427 IGF1RP08069 1367 aa37.45■■■■□ 3.59
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