Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 SPTAN1-208ENST00000491712 714 ntTSL 216.65■□□□□ 0.261e-7■■■□□ 16
G3BP1Q13283 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.693e-13■■■□□ 16
G3BP1Q13283 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.283e-6■■■□□ 16
G3BP1Q13283 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.13e-6■■■□□ 16
G3BP1Q13283 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.363e-6■■■□□ 16
G3BP1Q13283 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.268e-7■■■□□ 16
G3BP1Q13283 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.083e-6■■■□□ 16
G3BP1Q13283 CAPN1-208ENST00000527323 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.043e-6■■■□□ 16
G3BP1Q13283 LANCL1-207ENST00000450366 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.278e-7■■■□□ 16
G3BP1Q13283 LANCL1-203ENST00000431941 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.538e-7■■■□□ 16
G3BP1Q13283 LANCL1-201ENST00000233714 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.858e-7■■■□□ 16
G3BP1Q13283 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.468e-7■■■□□ 16
G3BP1Q13283 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.555e-7■■■□□ 16
G3BP1Q13283 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.585e-7■■■□□ 16
G3BP1Q13283 GRHPR-206ENST00000487399 952 ntTSL 217.17■□□□□ 0.347e-7■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 DCTN1-224ENST00000495895 503 ntTSL 211.69□□□□□ -0.549e-9■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 DDX27-204ENST00000484427 4929 ntTSL 1 (best)16.21■□□□□ 0.193e-6■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 DDX27-206ENST00000618172 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.023e-6■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 DDX27-201ENST00000371764 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.073e-6■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 DDX27-207ENST00000622530 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.373e-6■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 GLUL-211ENST00000489818 683 ntTSL 312.31□□□□□ -0.446e-9■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 KRT8-209ENST00000547176 250 ntTSL 517.07■□□□□ 0.323e-9■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 TWF2-202ENST00000472755 584 ntTSL 225.91■■□□□ 1.743e-7■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 JUP-202ENST00000393930 3298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.12e-6■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 JUP-201ENST00000310706 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.22e-6■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 JUP-203ENST00000393931 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.292e-6■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.251e-6■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.151e-6■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 LAS1L-205ENST00000484069 5205 ntTSL 215.8■□□□□ 0.121e-6■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 LAS1L-203ENST00000374811 2439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.041e-6■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.648e-11■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.318e-11■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 FDFT1-218ENST00000530664 1761 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.058e-11■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 FDFT1-225ENST00000622850 1987 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.248e-11■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 LMNA-204ENST00000368298 1475 ntTSL 1 (best)23.15■■□□□ 1.35e-9■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 DDB1-208ENST00000537120 1215 ntTSL 210.39□□□□□ -0.751e-8■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.198e-7■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.068e-7■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 HSPA9-201ENST00000297185 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.385e-7■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.744e-7■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.664e-7■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 CCNB1-202ENST00000503507 750 ntTSL 519.1■□□□□ 0.654e-6■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 CCNB1-204ENST00000506572 1331 ntTSL 1 (best)18.97■□□□□ 0.634e-6■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.434e-6■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 CCNB1-206ENST00000508407 780 ntTSL 29.26□□□□□ -0.934e-6■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 CCNB1-203ENST00000505500 1190 ntTSL 1 (best)9.13□□□□□ -0.954e-6■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 MTHFD1-202ENST00000545908 6814 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.629e-7■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 MTHFD1-201ENST00000216605 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.679e-7■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 TRRAP-205ENST00000456197 11654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)9.07□□□□□ -0.968e-7■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.038e-7■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.038e-7■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.048e-7■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.258e-7■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.453e-6■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 DDX21-201ENST00000354185 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.793e-6■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.445e-7■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.65e-7■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 HNRNPA3-202ENST00000411529 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.465e-7■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.22e-9■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 KRT8-213ENST00000550170 2202 ntTSL 521.53■■□□□ 1.042e-9■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.912e-9■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.782e-9■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.592e-9■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 KRT8-203ENST00000546583 2862 ntTSL 517.76■□□□□ 0.432e-9■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 GOT2-205ENST00000496461 981 ntTSL 216.98■□□□□ 0.312e-7■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 IARS-208ENST00000472894 651 ntTSL 38.37□□□□□ -1.074e-7■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 ACLY-204ENST00000537919 2974 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.061e-8■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 ACLY-203ENST00000393896 3682 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.221e-8■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 ACLY-207ENST00000590151 4309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.61e-8■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 ACLY-202ENST00000353196 4318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.631e-8■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 ACLY-201ENST00000352035 4339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.731e-8■■■□□ 15.9
G3BP1Q13283 MYH9-210ENST00000486218 788 ntTSL 323.53■■□□□ 1.369e-12■■■□□ 15.8
G3BP1Q13283 MYH9-208ENST00000475726 768 ntTSL 319.11■□□□□ 0.659e-12■■■□□ 15.8
G3BP1Q13283 SH3BP4-204ENST00000416021 593 ntTSL 326.18■■□□□ 1.788e-6■■■□□ 15.8
G3BP1Q13283 SH3BP4-205ENST00000444916 570 ntTSL 417.5■□□□□ 0.398e-6■■■□□ 15.8
G3BP1Q13283 SH3BP4-206ENST00000446904 829 ntTSL 312.73□□□□□ -0.378e-6■■■□□ 15.8
G3BP1Q13283 SH3BP4-207ENST00000454947 500 ntTSL 411.58□□□□□ -0.568e-6■■■□□ 15.8
G3BP1Q13283 PDHB-208ENST00000480626 710 ntTSL 321.87■■□□□ 1.093e-7■■■□□ 15.8
G3BP1Q13283 GORASP2-208ENST00000488928 546 ntTSL 36.36□□□□□ -1.393e-6■■■□□ 15.8
G3BP1Q13283 CTNNA1-243ENST00000540387 2684 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.717e-8■■■□□ 15.8
G3BP1Q13283 NUDC-204ENST00000484772 607 ntTSL 215.63■□□□□ 0.092e-10■■■□□ 15.8
G3BP1Q13283 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.294e-6■■■□□ 15.8
G3BP1Q13283 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.884e-6■■■□□ 15.8
G3BP1Q13283 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.864e-6■■■□□ 15.8
G3BP1Q13283 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.74e-6■■■□□ 15.8
G3BP1Q13283 GNB2-212ENST00000470354 902 ntTSL 524.59■■□□□ 1.534e-6■■■□□ 15.8
G3BP1Q13283 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.074e-6■■■□□ 15.8
G3BP1Q13283 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.914e-6■■■□□ 15.8
G3BP1Q13283 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.64e-6■■■□□ 15.8
G3BP1Q13283 GNB2-211ENST00000469287 1702 ntTSL 218.68■□□□□ 0.584e-6■■■□□ 15.8
G3BP1Q13283 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.783e-7■■■□□ 15.8
G3BP1Q13283 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.093e-7■■■□□ 15.8
G3BP1Q13283 PRMT5-218ENST00000555454 771 ntTSL 59.71□□□□□ -0.862e-6■■■□□ 15.8
G3BP1Q13283 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.178e-7■■■□□ 15.8
G3BP1Q13283 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.978e-7■■■□□ 15.8
G3BP1Q13283 LMNA-220ENST00000504687 546 ntTSL 416.35■□□□□ 0.219e-9■■■□□ 15.8
G3BP1Q13283 IDH3B-208ENST00000479376 436 ntTSL 214.12□□□□□ -0.157e-7■■■□□ 15.8
G3BP1Q13283 FDFT1-221ENST00000532266 583 ntTSL 510.67□□□□□ -0.71e-10■■■□□ 15.8
G3BP1Q13283 NUMA1-213ENST00000537217 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)21.35■■□□□ 1.012e-6■■■□□ 15.8
G3BP1Q13283 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.031e-6■■■□□ 15.8
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