Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MC1RQ01726 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms