Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH9

SLTM, SAFB-like transcription modulator, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLTMQ9NWH9 ZNF44-205ENST00000397742 2372 ntTSL 215.61■□□□□ 0.092e-6■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.114e-9■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 RCOR3-211ENST00000528926 1497 ntTSL 214.06□□□□□ -0.162e-6■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 ZNF44-202ENST00000355684 2119 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.22e-6■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.24e-9■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 FN1-206ENST00000359671 8524 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.244e-9■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 SH3BP1-203ENST00000451997 3123 ntTSL 213.46□□□□□ -0.252e-6■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 ZNF44-208ENST00000600003 2051 ntTSL 213.13□□□□□ -0.312e-6■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 THRAP3-201ENST00000354618 4432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.312e-6■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 FN1-212ENST00000446046 7952 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.324e-9■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 RNF31-224ENST00000560787 2834 ntTSL 213.06□□□□□ -0.322e-6■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.342e-6■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 THRAP3-203ENST00000469141 3339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.362e-6■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 FN1-211ENST00000443816 7762 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.414e-9■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 AL136295.5-201ENST00000558468 4798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.422e-6■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 FN1-207ENST00000421182 8103 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.424e-9■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 FN1-204ENST00000356005 7846 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.434e-9■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 FN1-203ENST00000354785 8905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.464e-9■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 ZNF44-203ENST00000356109 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.472e-6■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 FN1-205ENST00000357867 7898 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.474e-9■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 ZNF44-201ENST00000354656 517 ntTSL 311.94□□□□□ -0.52e-6■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 GMDS-210ENST00000533279 817 ntTSL 511.83□□□□□ -0.522e-6■■■□□ 19.1
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SLTMQ9NWH9 FN1-209ENST00000432072 7759 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.664e-9■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 ZNF44-204ENST00000393337 3236 ntTSL 1 (best)9.99□□□□□ -0.812e-6■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 RCOR3-214ENST00000533469 540 ntTSL 49.84□□□□□ -0.832e-6■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 HNF1A-AS1-202ENST00000535301 536 ntTSL 4 BASIC8.44□□□□□ -1.062e-6■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.072e-6■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 FN1-213ENST00000456923 3720 ntTSL 27.46□□□□□ -1.214e-9■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 USP34-204ENST00000453133 1409 ntTSL 57□□□□□ -1.292e-6■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 RCOR3-212ENST00000529572 1022 ntTSL 56.88□□□□□ -1.312e-6■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.452e-6■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 FN1-224ENST00000492816 9171 ntTSL 56□□□□□ -1.454e-9■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.532e-6■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.622e-6■■■□□ 19.1
SLTMQ9NWH9 TSPAN4-217ENST00000527644 968 ntTSL 227.37■■□□□ 1.976e-7■■■□□ 19
SLTMQ9NWH9 RSRP1-214ENST00000566599 945 ntTSL 1 (best)22.36■■□□□ 1.174e-10■■■□□ 19
SLTMQ9NWH9 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.036e-7■■■□□ 19
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SLTMQ9NWH9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.088e-8■■■□□ 19
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SLTMQ9NWH9 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.182e-6■■■□□ 18.9
SLTMQ9NWH9 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.032e-6■■■□□ 18.9
SLTMQ9NWH9 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.483e-8■■■□□ 18.9
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SLTMQ9NWH9 PPP1R37-206ENST00000544069 712 ntTSL 524.37■■□□□ 1.492e-6■■■□□ 18.9
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SLTMQ9NWH9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.931e-6■■■□□ 18.9
SLTMQ9NWH9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.521e-6■■■□□ 18.9
SLTMQ9NWH9 LMF1-203ENST00000545827 2731 ntTSL 217.27■□□□□ 0.361e-6■■■□□ 18.9
SLTMQ9NWH9 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.282e-6■■■□□ 18.9
SLTMQ9NWH9 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.246e-9■■■□□ 18.9
SLTMQ9NWH9 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.222e-6■■■□□ 18.9
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SLTMQ9NWH9 MARK4-203ENST00000587566 553 ntTSL 514.59□□□□□ -0.072e-6■■■□□ 18.9
SLTMQ9NWH9 CCDC144NL-AS1-218ENST00000583962 3352 ntTSL 1 (best)12.33□□□□□ -0.431e-6■■■□□ 18.9
SLTMQ9NWH9 CCDC144NL-AS1-207ENST00000577537 3727 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.491e-6■■■□□ 18.9
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SLTMQ9NWH9 AATK-202ENST00000374792 4938 ntTSL 221.57■■□□□ 1.044e-7■■■□□ 18.9
SLTMQ9NWH9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.594e-7■■■□□ 18.9
SLTMQ9NWH9 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.315e-7■■■□□ 18.9
SLTMQ9NWH9 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.175e-7■■■□□ 18.9
SLTMQ9NWH9 AATK-206ENST00000572798 407 ntTSL 213.34□□□□□ -0.274e-7■■■□□ 18.9
SLTMQ9NWH9 EPS15L1-204ENST00000592031 2788 ntTSL 212.13□□□□□ -0.475e-7■■■□□ 18.9
SLTMQ9NWH9 EPS15L1-203ENST00000535753 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.545e-7■■■□□ 18.9
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SLTMQ9NWH9 NIPBL-202ENST00000448238 8729 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.662e-7■■■□□ 18.8
SLTMQ9NWH9 NIPBL-201ENST00000282516 10435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.752e-7■■■□□ 18.8
SLTMQ9NWH9 RBM12B-203ENST00000518597 579 ntTSL 212.17□□□□□ -0.462e-7■■■□□ 18.8
SLTMQ9NWH9 RBM12B-205ENST00000520560 588 ntTSL 210.63□□□□□ -0.712e-7■■■□□ 18.8
SLTMQ9NWH9 PLXNB2-203ENST00000425954 609 ntTSL 218.08■□□□□ 0.489e-7■■■□□ 18.8
SLTMQ9NWH9 RBM39-215ENST00000442447 644 ntTSL 216.78■□□□□ 0.282e-6■■■□□ 18.8
SLTMQ9NWH9 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.282e-6■■■□□ 18.8
SLTMQ9NWH9 RBM39-204ENST00000374038 1026 ntTSL 516.29■□□□□ 0.22e-6■■■□□ 18.8
SLTMQ9NWH9 RBM39-219ENST00000453310 1068 ntTSL 216.29■□□□□ 0.22e-6■■■□□ 18.8
SLTMQ9NWH9 RBM39-213ENST00000433027 611 ntTSL 516.02■□□□□ 0.162e-6■■■□□ 18.8
SLTMQ9NWH9 RBM39-212ENST00000429968 2149 ntTSL 214.87□□□□□ -0.032e-6■■■□□ 18.8
SLTMQ9NWH9 RBM39-216ENST00000444878 2124 ntTSL 214.57□□□□□ -0.082e-6■■■□□ 18.8
SLTMQ9NWH9 RBM39-207ENST00000412738 1018 ntTSL 314.28□□□□□ -0.122e-6■■■□□ 18.8
SLTMQ9NWH9 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.182e-6■■■□□ 18.8
SLTMQ9NWH9 RBM39-245ENST00000639702 5914 ntTSL 513.83□□□□□ -0.22e-6■■■□□ 18.8
SLTMQ9NWH9 RBM39-203ENST00000361162 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.332e-6■■■□□ 18.8
SLTMQ9NWH9 RBM39-206ENST00000403542 2883 ntTSL 212.78□□□□□ -0.362e-6■■■□□ 18.8
SLTMQ9NWH9 RBM39-202ENST00000338163 2792 ntTSL 212.66□□□□□ -0.382e-6■■■□□ 18.8
SLTMQ9NWH9 RBM39-223ENST00000463004 4580 ntTSL 512.42□□□□□ -0.422e-6■■■□□ 18.8
SLTMQ9NWH9 DSCR4-201ENST00000328264 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.61e-6■■■□□ 18.8
SLTMQ9NWH9 RBM39-214ENST00000434927 716 ntTSL 59.62□□□□□ -0.872e-6■■■□□ 18.8
SLTMQ9NWH9 DSCR4-202ENST00000398948 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.991e-6■■■□□ 18.8
SLTMQ9NWH9 RBM39-208ENST00000416108 577 ntTSL 48.74□□□□□ -1.012e-6■■■□□ 18.8
SLTMQ9NWH9 RBM39-209ENST00000416529 594 ntTSL 38.01□□□□□ -1.132e-6■■■□□ 18.8
SLTMQ9NWH9 RBM39-218ENST00000449489 432 ntTSL 57.43□□□□□ -1.222e-6■■■□□ 18.8
SLTMQ9NWH9 RBM39-232ENST00000481037 687 ntTSL 37.42□□□□□ -1.222e-6■■■□□ 18.8
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