Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 POFUT2-212ENST00000493811 577 ntTSL 322.76■■□□□ 1.233e-6■■■■■ 27.2
DROSHAQ9NRR4 POFUT2-211ENST00000493524 890 ntTSL 522.19■■□□□ 1.143e-6■■■■■ 27.2
DROSHAQ9NRR4 POFUT2-207ENST00000468360 757 ntTSL 520.59■□□□□ 0.893e-6■■■■■ 27.2
DROSHAQ9NRR4 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.614e-17■■■■■ 27.2
DROSHAQ9NRR4 KCMF1-204ENST00000456682 661 ntTSL 340.22■■■■■ 4.032e-6■■■■■ 27.2
DROSHAQ9NRR4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 27.2
DROSHAQ9NRR4 CTDSP1-212ENST00000494067 362 ntTSL 320.85■□□□□ 0.932e-8■■■■■ 27.2
DROSHAQ9NRR4 LAMA5-202ENST00000370677 1674 ntTSL 230.29■■■□□ 2.448e-7■■■■■ 27.2
DROSHAQ9NRR4 PIP5K1C-204ENST00000587482 1311 ntTSL 524.82■■□□□ 1.561e-6■■■■■ 27.1
DROSHAQ9NRR4 B3GNTL1-203ENST00000571218 459 ntTSL 218.93■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 27.1
DROSHAQ9NRR4 ANKRD11-209ENST00000564553 471 ntTSL 321.27■■□□□ 18e-8■■■■■ 27.1
DROSHAQ9NRR4 ANKRD11-206ENST00000562275 2762 ntTSL 519.98■□□□□ 0.798e-8■■■■■ 27.1
DROSHAQ9NRR4 ANKRD11-202ENST00000330736 8342 ntTSL 514.89□□□□□ -0.038e-8■■■■■ 27.1
DROSHAQ9NRR4 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.88□□□□□ -2.114e-8■■■■■ 27
DROSHAQ9NRR4 PIP5K1C-208ENST00000637724 435 ntTSL 331.46■■■□□ 2.631e-6■■■■■ 27
DROSHAQ9NRR4 RER1-208ENST00000493207 686 ntTSL 225.78■■□□□ 1.724e-10■■■■■ 27
DROSHAQ9NRR4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.23e-7■■■■■ 27
DROSHAQ9NRR4 SHC2-205ENST00000590170 816 ntTSL 528.17■■■□□ 2.11e-6■■■■■ 27
DROSHAQ9NRR4 RGS20-208ENST00000523064 610 ntTSL 1 (best)32.85■■■□□ 2.851e-6■■■■■ 27
DROSHAQ9NRR4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.531e-6■■■■■ 27
DROSHAQ9NRR4 RGS20-210ENST00000523414 668 ntTSL 227.45■■□□□ 1.981e-6■■■■■ 27
DROSHAQ9NRR4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.981e-6■■■■■ 27
DROSHAQ9NRR4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.541e-6■■■■■ 27
DROSHAQ9NRR4 RGS20-206ENST00000518286 455 ntTSL 322.02■■□□□ 1.121e-6■■■■■ 27
DROSHAQ9NRR4 RGS20-207ENST00000522225 1559 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 27
DROSHAQ9NRR4 RGS20-205ENST00000517659 1518 ntTSL 1 (best)8.21□□□□□ -1.11e-6■■■■■ 27
DROSHAQ9NRR4 RGS20-209ENST00000523280 1434 ntTSL 1 (best)6.27□□□□□ -1.411e-6■■■■■ 27
DROSHAQ9NRR4 DDX17-206ENST00000467279 712 ntTSL 536.3■■■■□ 3.41e-17■■■■■ 26.9
DROSHAQ9NRR4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.811e-17■■■■■ 26.9
DROSHAQ9NRR4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.811e-17■■■■■ 26.9
DROSHAQ9NRR4 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.759e-13■■■■■ 26.9
DROSHAQ9NRR4 TAOK1-206ENST00000587277 353 ntTSL 22.7□□□□□ -1.989e-13■■■■■ 26.9
DROSHAQ9NRR4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.099e-7■■■■■ 26.9
DROSHAQ9NRR4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.662e-6■■■■■ 26.9
DROSHAQ9NRR4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.212e-6■■■■■ 26.9
DROSHAQ9NRR4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.072e-6■■■■■ 26.9
DROSHAQ9NRR4 SDF4-205ENST00000465727 2095 ntTSL 227.75■■■□□ 2.032e-6■■■■■ 26.9
DROSHAQ9NRR4 SDF4-203ENST00000403997 728 ntTSL 320.4■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 26.9
DROSHAQ9NRR4 BRD2-217ENST00000584808 547 ntTSL 431.17■■■□□ 2.582e-7■■■■■ 26.8
DROSHAQ9NRR4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.82■■■■■ 4.292e-7■■■■■ 26.8
DROSHAQ9NRR4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.832e-7■■■■■ 26.8
DROSHAQ9NRR4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.437e-7■■■■■ 26.8
DROSHAQ9NRR4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.794e-9■■■■■ 26.8
DROSHAQ9NRR4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.324e-9■■■■■ 26.8
DROSHAQ9NRR4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.254e-9■■■■■ 26.8
DROSHAQ9NRR4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.034e-9■■■■■ 26.8
DROSHAQ9NRR4 TLE3-209ENST00000557919 4294 ntTSL 519.48■□□□□ 0.714e-9■■■■■ 26.8
DROSHAQ9NRR4 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.594e-9■■■■■ 26.8
DROSHAQ9NRR4 TLE3-225ENST00000561453 3719 ntTSL 517.89■□□□□ 0.464e-9■■■■■ 26.8
DROSHAQ9NRR4 AATK-208ENST00000573469 754 ntTSL 527.76■■■□□ 2.039e-9■■■■■ 26.8
DROSHAQ9NRR4 AATK-205ENST00000572339 679 ntTSL 426.46■■□□□ 1.839e-9■■■■■ 26.8
DROSHAQ9NRR4 AATK-202ENST00000374792 4938 ntTSL 224.99■■□□□ 1.599e-9■■■■■ 26.8
DROSHAQ9NRR4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.379e-9■■■■■ 26.8
DROSHAQ9NRR4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.079e-9■■■■■ 26.8
DROSHAQ9NRR4 ZDHHC8-204ENST00000436518 557 ntTSL 424.49■■□□□ 1.513e-6■■■■■ 26.8
DROSHAQ9NRR4 ZDHHC8-205ENST00000468112 524 ntTSL 322.25■■□□□ 1.153e-6■■■■■ 26.8
DROSHAQ9NRR4 MCRIP2-202ENST00000474840 702 ntTSL 1 (best)40.88■■■■■ 4.141e-7■■■■■ 26.8
DROSHAQ9NRR4 MCRIP2-203ENST00000491999 1050 ntTSL 535.3■■■■□ 3.241e-7■■■■■ 26.8
DROSHAQ9NRR4 MCRIP2-210ENST00000620462 1594 ntTSL 529.02■■■□□ 2.241e-7■■■■■ 26.8
DROSHAQ9NRR4 MCRIP2-206ENST00000615744 1379 ntTSL 328.43■■■□□ 2.141e-7■■■■■ 26.8
DROSHAQ9NRR4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.931e-7■■■■■ 26.8
DROSHAQ9NRR4 MCRIP2-209ENST00000619674 2306 ntTSL 225.39■■□□□ 1.661e-7■■■■■ 26.8
DROSHAQ9NRR4 MCRIP2-205ENST00000611328 628 ntTSL 323.36■■□□□ 1.331e-7■■■■■ 26.8
DROSHAQ9NRR4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.582e-7■■■■□ 26.7
DROSHAQ9NRR4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.342e-7■■■■□ 26.7
DROSHAQ9NRR4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.322e-7■■■■□ 26.7
DROSHAQ9NRR4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.022e-7■■■■□ 26.7
DROSHAQ9NRR4 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.992e-7■■■■□ 26.7
DROSHAQ9NRR4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.942e-7■■■■□ 26.7
DROSHAQ9NRR4 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.552e-7■■■■□ 26.7
DROSHAQ9NRR4 LINC00894-205ENST00000449111 3414 ntTSL 513.76□□□□□ -0.218e-7■■■■□ 26.7
DROSHAQ9NRR4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.991e-6■■■■□ 26.7
DROSHAQ9NRR4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.184e-7■■■■□ 26.6
DROSHAQ9NRR4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.12e-7■■■■□ 26.6
DROSHAQ9NRR4 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.422e-7■■■■□ 26.6
DROSHAQ9NRR4 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.682e-7■■■■□ 26.6
DROSHAQ9NRR4 CBFA2T3-210ENST00000569464 1327 ntTSL 1 (best)21.16■□□□□ 0.989e-7■■■■□ 26.6
DROSHAQ9NRR4 ABCA2-207ENST00000437791 697 ntTSL 529.43■■■□□ 2.32e-12■■■■□ 26.6
DROSHAQ9NRR4 ABCA2-217ENST00000479446 6295 ntTSL 1 (best)23.43■■□□□ 1.342e-12■■■■□ 26.6
DROSHAQ9NRR4 ABCA2-209ENST00000463603 655 ntTSL 323.18■■□□□ 1.32e-12■■■■□ 26.6
DROSHAQ9NRR4 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.112e-12■■■■□ 26.6
DROSHAQ9NRR4 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.112e-12■■■■□ 26.6
DROSHAQ9NRR4 ABCA2-218ENST00000487109 8031 ntTSL 1 (best)14.41□□□□□ -0.12e-12■■■■□ 26.6
DROSHAQ9NRR4 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.132e-12■■■■□ 26.6
DROSHAQ9NRR4 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.162e-12■■■■□ 26.6
DROSHAQ9NRR4 ABCA2-208ENST00000459850 8073 ntTSL 1 (best)13.75□□□□□ -0.212e-12■■■■□ 26.6
DROSHAQ9NRR4 FKBP2-204ENST00000535135 639 ntTSL 337.8■■■■□ 3.643e-8■■■■□ 26.5
DROSHAQ9NRR4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.443e-8■■■■□ 26.5
DROSHAQ9NRR4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.255e-14■■■■□ 26.5
DROSHAQ9NRR4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.875e-14■■■■□ 26.5
DROSHAQ9NRR4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.375e-14■■■■□ 26.5
DROSHAQ9NRR4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.145e-14■■■■□ 26.5
DROSHAQ9NRR4 FOSL1-205ENST00000534222 584 ntTSL 320.97■□□□□ 0.955e-14■■■■□ 26.5
DROSHAQ9NRR4 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC9.23□□□□□ -0.933e-7■■■■□ 26.5
DROSHAQ9NRR4 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC5.92□□□□□ -1.463e-7■■■■□ 26.5
DROSHAQ9NRR4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.34■■■■■ 4.691e-8■■■■□ 26.5
DROSHAQ9NRR4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.771e-8■■■■□ 26.5
DROSHAQ9NRR4 ZC3H3-202ENST00000528401 546 ntTSL 327.52■■■□□ 22e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 DAZAP1-208ENST00000589874 3642 nt19.19■□□□□ 0.661e-6■■■■□ 26.4
DROSHAQ9NRR4 CHTF18-212ENST00000493715 691 ntTSL 321.77■■□□□ 1.087e-10■■■■□ 26.4
Retrieved 100 of 16,331 protein–RNA pairs in 21 ms