Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ9

COX4I2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I2Q96KJ9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COX4I2Q96KJ9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COX4I2Q96KJ9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COX4I2Q96KJ9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
COX4I2Q96KJ9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX4I2Q96KJ9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX4I2Q96KJ9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX4I2Q96KJ9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
COX4I2Q96KJ9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX4I2Q96KJ9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX4I2Q96KJ9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX4I2Q96KJ9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX4I2Q96KJ9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX4I2Q96KJ9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms