Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP3Q15836 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VAMP3Q15836 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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