Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 ACAD10-201ENST00000313698 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.95e-6■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 ACAD10-202ENST00000413681 2951 ntTSL 27.48□□□□□ -1.215e-6■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 POLQ-201ENST00000264233 8775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.112e-6■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.312e-6■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 MLLT10-206ENST00000420525 538 ntTSL 33.22□□□□□ -1.894e-9■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.321e-6■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.421e-6■■■■□ 23.3
ILF3Q12906 RERE-213ENST00000480342 2710 ntTSL 29.02□□□□□ -0.977e-8■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.158e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.088e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.338e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.348e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.683e-8■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 FBXO18-208ENST00000470089 979 ntTSL 529.09■■■□□ 2.251e-6■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.891e-6■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 PPP2CA-201ENST00000231504 564 ntTSL 426.65■■□□□ 1.867e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.817e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.767e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.587e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 LRRC8D-205ENST00000525774 588 ntTSL 423.93■■□□□ 1.427e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.187e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.17e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 SNX1-210ENST00000560260 1326 ntTSL 1 (best)21.44■■□□□ 1.027e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 SNX1-206ENST00000559389 753 ntTSL 521.38■■□□□ 1.017e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 CHID1-216ENST00000529539 602 ntTSL 221.25■□□□□ 0.997e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.947e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.887e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.857e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.827e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.797e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 KMT2E-214ENST00000495267 1133 ntTSL 1 (best)19.98■□□□□ 0.793e-6■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 C7orf50-208ENST00000491163 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 319.84■□□□□ 0.771e-6■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 KMT2E-211ENST00000480368 679 ntTSL 519.75■□□□□ 0.753e-6■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 HAAO-206ENST00000406924 1103 ntTSL 219.36■□□□□ 0.697e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.661e-6■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.647e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 TRABD-205ENST00000463233 2404 ntTSL 1 (best)19.02■□□□□ 0.637e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.557e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.541e-6■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 FIS1-206ENST00000473527 1005 ntTSL 1 (best)18.4■□□□□ 0.547e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.547e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.487e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 EP400-202ENST00000332482 2588 ntTSL 1 (best)18.06■□□□□ 0.487e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.477e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 HAAO-203ENST00000402698 1522 ntTSL 517.78■□□□□ 0.447e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 CHID1-223ENST00000534207 1171 ntTSL 517.71■□□□□ 0.437e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.397e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 C11orf24-205ENST00000530166 941 ntTSL 317.27■□□□□ 0.367e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.357e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 TRIB3-203ENST00000449710 1070 ntTSL 517.1■□□□□ 0.337e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 C11orf24-202ENST00000527280 533 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.08■□□□□ 0.327e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.327e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.327e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 DPY30-204ENST00000422413 601 ntTSL 317.04■□□□□ 0.327e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.327e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.37e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.33e-6■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 SNX1-203ENST00000558040 774 ntTSL 516.5■□□□□ 0.237e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 KMT2E-209ENST00000478990 1500 ntTSL 516.45■□□□□ 0.223e-6■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 CTDSPL-204ENST00000435525 371 ntTSL 316.34■□□□□ 0.217e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.187e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 HAAO-207ENST00000431905 827 ntTSL 316.18■□□□□ 0.187e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.187e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.177e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.155e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.17e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.17e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.091e-6■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.087e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.071e-6■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.047e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 07e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 KMT2E-203ENST00000334884 6840 ntTSL 515.04■□□□□ -03e-6■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 GGT7-204ENST00000470952 427 ntTSL 515.01□□□□□ -0.015e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.017e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 HAAO-204ENST00000404451 651 ntTSL 314.94□□□□□ -0.027e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.027e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.043e-6■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.047e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.067e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.077e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 FIS1-202ENST00000435848 692 ntTSL 514.48□□□□□ -0.097e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.093e-6■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 GCNT2-215ENST00000489819 409 ntTSL 1 (best)14.43□□□□□ -0.17e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 CTSB-211ENST00000526481 660 ntTSL 514.19□□□□□ -0.147e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 GGT7-203ENST00000469018 1064 ntTSL 514.12□□□□□ -0.155e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.167e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.167e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.187e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.187e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.237e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.237e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 CHID1-214ENST00000528534 321 ntTSL 313.28□□□□□ -0.287e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.297e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 DPY30-205ENST00000430665 524 ntTSL 513.09□□□□□ -0.317e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.327e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 DPY30-203ENST00000414013 523 ntTSL 312.77□□□□□ -0.377e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 NME2-208ENST00000570801 565 ntTSL 212.64□□□□□ -0.397e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.417e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 NME1-NME2-201ENST00000376392 894 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.417e-7■■■■□ 23.2
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