RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-208ENST00000470089 NISCHQ9Y2I1 1504 aa71.68■■■■■ 9.06
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FBXO18-208ENST00000470089 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa60.25■■■■■ 7.24
FBXO18-208ENST00000470089 DCAF8L2P0C7V8 631 aa60.12■■■■■ 7.21
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FBXO18-208ENST00000470089 MYO15BQ96JP2 1530 aa59.54■■■■■ 7.12
FBXO18-208ENST00000470089 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa59.21■■■■■ 7.07
FBXO18-208ENST00000470089 UNC13AQ9UPW8 1703 aa59■■■■■ 7.04
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FBXO18-208ENST00000470089 BICRAQ9NZM4 1560 aa58.49■■■■■ 6.95
FBXO18-208ENST00000470089 SCRIBQ14160 1630 aa58.34■■■■■ 6.93
FBXO18-208ENST00000470089 DNAJC5BQ9UF47 199 aa57.97■■■■■ 6.87
FBXO18-208ENST00000470089 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa57.68■■■■■ 6.82
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FBXO18-208ENST00000470089 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa56.83■■■■■ 6.69
FBXO18-208ENST00000470089 CECR2Q9BXF3 1484 aa56.46■■■■■ 6.63
FBXO18-208ENST00000470089 SMARCA4P51532 1647 aa55.72■■■■■ 6.51
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FBXO18-208ENST00000470089 NCAPD3P42695 1498 aa55.43■■■■■ 6.46
FBXO18-208ENST00000470089 SMARCA2P51531 1590 aa55.36■■■■■ 6.45
FBXO18-208ENST00000470089 MROH2BQ7Z745 1585 aa55.29■■■■■ 6.44
FBXO18-208ENST00000470089 HMGXB3Q12766 1538 aa55.15■■■■■ 6.42
FBXO18-208ENST00000470089 PEG3Q9GZU2 1588 aa55.1■■■■■ 6.41
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FBXO18-208ENST00000470089 ERCC6Q03468 1493 aa54.17■■■■■ 6.26
FBXO18-208ENST00000470089 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa54.04■■■■■ 6.24
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FBXO18-208ENST00000470089 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa53.69■■■■■ 6.18
FBXO18-208ENST00000470089 PDS5BQ9NTI5 1447 aa53.68■■■■■ 6.18
FBXO18-208ENST00000470089 CUX2O14529 1486 aa53.64■■■■■ 6.18
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FBXO18-208ENST00000470089 CCDC88BA6NC98 1476 aa53.42■■■■■ 6.14
FBXO18-208ENST00000470089 FANCD2Q9BXW9 1451 aa53.25■■■■■ 6.11
FBXO18-208ENST00000470089 CEP164Q9UPV0 1460 aa53.2■■■■■ 6.11
FBXO18-208ENST00000470089 MRC2Q9UBG0 1479 aa53.18■■■■■ 6.1
FBXO18-208ENST00000470089 PRDM2Q13029 1718 aa53.09■■■■■ 6.09
FBXO18-208ENST00000470089 WDR62O43379 1518 aa53.01■■■■■ 6.08
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FBXO18-208ENST00000470089 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP52.76■■■■■ 6.04
FBXO18-208ENST00000470089 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa52.37■■■■■ 5.97
FBXO18-208ENST00000470089 TOPBP1Q92547 1522 aa52.36■■■■■ 5.97
FBXO18-208ENST00000470089 DNMBPQ6XZF7 1577 aa52.27■■■■■ 5.96
FBXO18-208ENST00000470089 ABCC8Q09428 1581 aa52.25■■■■■ 5.96
FBXO18-208ENST00000470089 IFT140Q96RY7 1462 aa52.06■■■■■ 5.92
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FBXO18-208ENST00000470089 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa51.73■■■■■ 5.87
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FBXO18-208ENST00000470089 SOGA1O94964 1423 aa51.67■■■■■ 5.86
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FBXO18-208ENST00000470089 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP51.39■■■■■ 5.82
FBXO18-208ENST00000470089 OSCARQ8IYS5 282 aa51.38■■■■■ 5.82
FBXO18-208ENST00000470089 SYNJ1O43426 1573 aa51.35■■■■■ 5.81
FBXO18-208ENST00000470089 WDR97A6NE52 1622 aa51.35■■■■■ 5.81
FBXO18-208ENST00000470089 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa51.34■■■■■ 5.81
FBXO18-208ENST00000470089 TOP2BQ02880 1626 aa51.32■■■■■ 5.81
FBXO18-208ENST00000470089 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa51.18■■■■■ 5.78
FBXO18-208ENST00000470089 CHD1O14646 1710 aa51.17■■■■■ 5.78
FBXO18-208ENST00000470089 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa51.11■■■■■ 5.77
FBXO18-208ENST00000470089 GRIN2BQ13224 1484 aa51.09■■■■■ 5.77
FBXO18-208ENST00000470089 GAPVD1Q14C86 1478 aa51.08■■■■■ 5.77
FBXO18-208ENST00000470089 FBLN2P98095 1184 aa51.07■■■■■ 5.77
FBXO18-208ENST00000470089 PBRM1Q86U86 1689 aa51.05■■■■■ 5.76
FBXO18-208ENST00000470089 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa51.04■■■■■ 5.76
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FBXO18-208ENST00000470089 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa50.67■■■■■ 5.7
FBXO18-208ENST00000470089 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa50.67■■■■■ 5.7
FBXO18-208ENST00000470089 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa50.67■■■■■ 5.7
FBXO18-208ENST00000470089 TRIM41Q8WV44 630 aa50.65■■■■■ 5.7
FBXO18-208ENST00000470089 ARHGEF11O15085 1522 aa50.6■■■■■ 5.69
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FBXO18-208ENST00000470089 CLASP1Q7Z460 1538 aa50.52■■■■■ 5.68
FBXO18-208ENST00000470089 GRIN2AQ12879 1464 aa50.45■■■■■ 5.67
FBXO18-208ENST00000470089 FHAD1B1AJZ9 1412 aa50.45■■■■■ 5.67
FBXO18-208ENST00000470089 KIF27Q86VH2 1401 aa50.33■■■■■ 5.65
FBXO18-208ENST00000470089 CEP170Q5SW79 1584 aa50.25■■■■■ 5.63
FBXO18-208ENST00000470089 NUP160Q12769 1436 aa50.21■■■■■ 5.63
FBXO18-208ENST00000470089 ARAP1Q96P48 1450 aa50.18■■■■■ 5.62
FBXO18-208ENST00000470089 CYB5RLQ6IPT4 315 aa50.17■■■■■ 5.62
FBXO18-208ENST00000470089 IGF1RP08069 1367 aa50.17■■■■■ 5.62
FBXO18-208ENST00000470089 CUL7Q14999 1698 aa50.07■■■■■ 5.61
FBXO18-208ENST00000470089 ERCC6L2Q5T890 1561 aa49.89■■■■■ 5.58
FBXO18-208ENST00000470089 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa49.89■■■■■ 5.58
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FBXO18-208ENST00000470089 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa49.88■■■■■ 5.58
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