Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HKR1P10072 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HKR1P10072 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HKR1P10072 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HKR1P10072 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HKR1P10072 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HKR1P10072 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HKR1P10072 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HKR1P10072 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HKR1P10072 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HKR1P10072 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HKR1P10072 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HKR1P10072 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HKR1P10072 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HKR1P10072 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HKR1P10072 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HKR1P10072 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HKR1P10072 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HKR1P10072 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HKR1P10072 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HKR1P10072 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HKR1P10072 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HKR1P10072 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HKR1P10072 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HKR1P10072 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HKR1P10072 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HKR1P10072 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HKR1P10072 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HKR1P10072 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HKR1P10072 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HKR1P10072 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HKR1P10072 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HKR1P10072 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HKR1P10072 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HKR1P10072 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HKR1P10072 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HKR1P10072 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HKR1P10072 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HKR1P10072 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HKR1P10072 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HKR1P10072 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HKR1P10072 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HKR1P10072 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HKR1P10072 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HKR1P10072 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HKR1P10072 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HKR1P10072 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HKR1P10072 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HKR1P10072 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HKR1P10072 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HKR1P10072 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HKR1P10072 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HKR1P10072 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HKR1P10072 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HKR1P10072 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HKR1P10072 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HKR1P10072 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HKR1P10072 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HKR1P10072 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HKR1P10072 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HKR1P10072 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HKR1P10072 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HKR1P10072 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HKR1P10072 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HKR1P10072 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HKR1P10072 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HKR1P10072 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HKR1P10072 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HKR1P10072 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HKR1P10072 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HKR1P10072 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HKR1P10072 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HKR1P10072 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HKR1P10072 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HKR1P10072 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HKR1P10072 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HKR1P10072 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HKR1P10072 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HKR1P10072 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HKR1P10072 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HKR1P10072 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HKR1P10072 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HKR1P10072 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HKR1P10072 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HKR1P10072 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HKR1P10072 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HKR1P10072 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HKR1P10072 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HKR1P10072 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HKR1P10072 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HKR1P10072 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HKR1P10072 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HKR1P10072 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HKR1P10072 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HKR1P10072 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HKR1P10072 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HKR1P10072 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HKR1P10072 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HKR1P10072 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HKR1P10072 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms