Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PCNX2-203ENST00000344698 5348 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 GTF2I-218ENST00000620879 4352 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PDIK1L-204ENST00000619836 4252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ZKSCAN3-201ENST00000252211 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 CALM1-201ENST00000356978 4242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ELOVL1-216ENST00000621943 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ASB2-203ENST00000555019 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 LIPC-202ENST00000356113 2161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 KRBA1-201ENST00000319551 4020 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 RUNX2-AS1-201ENST00000563807 1513 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 NAV2-204ENST00000396087 7882 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 CAMK2B-209ENST00000395749 4447 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 TENM3-204ENST00000511685 10896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 YLPM1-201ENST00000325680 7108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 NTRK3-204ENST00000360948 3004 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 PLCXD1-203ENST00000399012 5287 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 UBASH3B-201ENST00000284273 6912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 RORC-201ENST00000318247 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 TUBB8P5-201ENST00000445286 1351 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 COPS7A-201ENST00000229251 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 ELP4-202ENST00000379163 1700 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 GGT8P-201ENST00000418938 532 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 CPT1C-203ENST00000392518 2910 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 CCDC112-201ENST00000379611 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 PLEKHG4-204ENST00000427155 4455 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 SHPRH-202ENST00000367503 5237 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 TRPC3-205ENST00000513531 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 VOPP1-217ENST00000625836 1400 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 GRIK1-206ENST00000399913 3234 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 IQCB1-202ENST00000349820 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 PCDHB6-201ENST00000231136 3266 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 ASPH-208ENST00000517856 6337 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 ZCCHC9-201ENST00000254037 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 ELMOD3-202ENST00000393852 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 FAS-204ENST00000355740 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 LIG1-221ENST00000613670 3949 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 XRRA1-201ENST00000321448 4695 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 SERPINI1-202ENST00000446050 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 TACC1-201ENST00000276520 6513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 INAVA-201ENST00000367342 4298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 TIPARP-202ENST00000461166 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 EXOC7-207ENST00000411744 2031 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TMEM225BP0DP42 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 503.3 ms