Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JSRP1Q96MG2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JSRP1Q96MG2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
JSRP1Q96MG2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
JSRP1Q96MG2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
JSRP1Q96MG2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JSRP1Q96MG2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JSRP1Q96MG2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
JSRP1Q96MG2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JSRP1Q96MG2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JSRP1Q96MG2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JSRP1Q96MG2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JSRP1Q96MG2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JSRP1Q96MG2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JSRP1Q96MG2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JSRP1Q96MG2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JSRP1Q96MG2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JSRP1Q96MG2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JSRP1Q96MG2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JSRP1Q96MG2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JSRP1Q96MG2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JSRP1Q96MG2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JSRP1Q96MG2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JSRP1Q96MG2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JSRP1Q96MG2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JSRP1Q96MG2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
JSRP1Q96MG2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms