Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC2

LARP4, La-related protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4Q71RC2 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.272e-10■■■■□ 22.9
LARP4Q71RC2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.163e-7■■■■□ 22.9
LARP4Q71RC2 NAT14-203ENST00000588985 730 ntTSL 519.44■□□□□ 0.73e-7■■■■□ 22.9
LARP4Q71RC2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.413e-7■■■■□ 22.9
LARP4Q71RC2 NAT14-205ENST00000592719 545 ntTSL 514.14□□□□□ -0.153e-7■■■■□ 22.9
LARP4Q71RC2 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.465e-7■■■■□ 22.8
LARP4Q71RC2 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.465e-7■■■■□ 22.8
LARP4Q71RC2 MRPS36-203ENST00000507022 298 ntTSL 36.67□□□□□ -1.345e-7■■■■□ 22.8
LARP4Q71RC2 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.535e-7■■■■□ 22.8
LARP4Q71RC2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.581e-6■■■■□ 22.8
LARP4Q71RC2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.591e-6■■■■□ 22.8
LARP4Q71RC2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.211e-6■■■■□ 22.8
LARP4Q71RC2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.951e-6■■■■□ 22.8
LARP4Q71RC2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.511e-6■■■■□ 22.8
LARP4Q71RC2 HEXIM1-201ENST00000332499 3600 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.425e-11■■■■□ 22.8
LARP4Q71RC2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.963e-44■■■■□ 22.8
LARP4Q71RC2 MIF-202ENST00000465752 589 ntTSL 1 (best)15.65■□□□□ 0.13e-44■■■■□ 22.8
LARP4Q71RC2 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.243e-44■■■■□ 22.8
LARP4Q71RC2 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.483e-8■■■■□ 22.7
LARP4Q71RC2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.411e-6■■■■□ 22.7
LARP4Q71RC2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.141e-6■■■■□ 22.7
LARP4Q71RC2 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.091e-6■■■■□ 22.7
LARP4Q71RC2 TIMM17B-205ENST00000466995 1528 ntTSL 214.28□□□□□ -0.121e-6■■■■□ 22.7
LARP4Q71RC2 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.371e-6■■■■□ 22.7
LARP4Q71RC2 WDR83OS-203ENST00000598732 627 ntTSL 211.41□□□□□ -0.582e-7■■■■□ 22.7
LARP4Q71RC2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.361e-7■■■■□ 22.7
LARP4Q71RC2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.361e-7■■■■□ 22.7
LARP4Q71RC2 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.181e-7■■■■□ 22.7
LARP4Q71RC2 NME1-206ENST00000475573 781 ntTSL 313.59□□□□□ -0.231e-7■■■■□ 22.7
LARP4Q71RC2 C20orf204-201ENST00000358393 1466 ntTSL 224.25■■□□□ 1.476e-7■■■■□ 22.7
LARP4Q71RC2 C20orf204-204ENST00000463337 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)21.12■□□□□ 0.976e-7■■■■□ 22.7
LARP4Q71RC2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.182e-6■■■■□ 22.7
LARP4Q71RC2 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.132e-6■■■■□ 22.7
LARP4Q71RC2 ABL1-202ENST00000372348 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.565e-6■■■■□ 22.7
LARP4Q71RC2 XRCC2-201ENST00000359321 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.842e-11■■■■□ 22.7
LARP4Q71RC2 XRCC2-202ENST00000495707 4728 ntTSL 1 (best)9.24□□□□□ -0.932e-11■■■■□ 22.7
LARP4Q71RC2 ABL1-203ENST00000393293 532 ntTSL 57.07□□□□□ -1.285e-6■■■■□ 22.7
LARP4Q71RC2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.488e-10■■■■□ 22.7
LARP4Q71RC2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.368e-10■■■■□ 22.7
LARP4Q71RC2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.188e-10■■■■□ 22.7
LARP4Q71RC2 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.057e-8■■■■□ 22.7
LARP4Q71RC2 LMNA-206ENST00000368300 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.467e-8■■■■□ 22.7
LARP4Q71RC2 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.394e-7■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.434e-7■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 PPIG-202ENST00000409714 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.811e-9■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.61e-9■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.691e-9■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 RETSAT-203ENST00000429806 2335 ntTSL 1 (best)12.34□□□□□ -0.434e-14■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 RETSAT-201ENST00000295802 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.844e-14■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 HSPB1-203ENST00000447574 1455 ntTSL 1 (best)18.8■□□□□ 0.63e-14■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.073e-14■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 HSPB1-202ENST00000429938 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.73e-14■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.731e-7■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.641e-7■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.055e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.035e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.935e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.935e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.932e-11■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.925e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.95e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 TMEM250-204ENST00000557985 1981 ntTSL 1 (best)20.68■□□□□ 0.95e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.885e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 THOC6-205ENST00000573704 991 ntTSL 520.33■□□□□ 0.855e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 THOC6-210ENST00000576143 960 ntTSL 320.33■□□□□ 0.855e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.735e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 LAMA5-202ENST00000370677 1674 ntTSL 219.18■□□□□ 0.665e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 THOC6-208ENST00000574957 1143 ntTSL 1 (best)18.98■□□□□ 0.635e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.625e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 POLD2-214ENST00000481104 541 ntTSL 218.93■□□□□ 0.625e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.615e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.565e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.525e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.515e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.485e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 ARPC4-204ENST00000440787 910 ntTSL 318■□□□□ 0.472e-11■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 ARPC4-202ENST00000417500 957 ntTSL 517.82■□□□□ 0.442e-11■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.345e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 FAM120C-204ENST00000497680 637 ntTSL 217.05■□□□□ 0.325e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.285e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 TMEM129-204ENST00000476253 958 ntTSL 216.65■□□□□ 0.265e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 TMEM59-208ENST00000452421 1074 ntTSL 516.57■□□□□ 0.245e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 POLD2-206ENST00000436844 854 ntTSL 516.46■□□□□ 0.235e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.215e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.212e-11■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 THOC6-206ENST00000574498 788 ntTSL 316.34■□□□□ 0.215e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.25e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 DCTD-203ENST00000500813 1829 ntTSL 216.14■□□□□ 0.175e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 THOC6-203ENST00000571046 614 ntTSL 215.82■□□□□ 0.125e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.095e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 THOC6-204ENST00000571057 988 ntTSL 1 (best)15.43■□□□□ 0.065e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -05e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.045e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.065e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.075e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.085e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 TMEM129-203ENST00000460722 1100 ntTSL 1 (best)14.49□□□□□ -0.095e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 USP5-204ENST00000537267 2522 ntTSL 514.39□□□□□ -0.115e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 RBP1-204ENST00000487424 1072 ntTSL 1 (best)14.38□□□□□ -0.115e-6■■■■□ 22.6
LARP4Q71RC2 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.125e-6■■■■□ 22.6
Retrieved 100 of 15,922 protein–RNA pairs in 625 ms