Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGDP52209 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PGDP52209 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGDP52209 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGDP52209 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGDP52209 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGDP52209 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PGDP52209 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGDP52209 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGDP52209 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGDP52209 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGDP52209 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGDP52209 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGDP52209 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGDP52209 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGDP52209 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGDP52209 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGDP52209 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGDP52209 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGDP52209 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGDP52209 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGDP52209 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGDP52209 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGDP52209 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGDP52209 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGDP52209 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGDP52209 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGDP52209 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGDP52209 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGDP52209 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGDP52209 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGDP52209 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGDP52209 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PGDP52209 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGDP52209 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGDP52209 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGDP52209 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGDP52209 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PGDP52209 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGDP52209 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGDP52209 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGDP52209 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGDP52209 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGDP52209 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGDP52209 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGDP52209 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGDP52209 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGDP52209 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGDP52209 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGDP52209 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGDP52209 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGDP52209 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGDP52209 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGDP52209 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGDP52209 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGDP52209 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGDP52209 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGDP52209 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGDP52209 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGDP52209 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGDP52209 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGDP52209 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGDP52209 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGDP52209 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGDP52209 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGDP52209 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGDP52209 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PGDP52209 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PGDP52209 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PGDP52209 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PGDP52209 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGDP52209 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PGDP52209 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PGDP52209 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGDP52209 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGDP52209 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGDP52209 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGDP52209 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGDP52209 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGDP52209 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGDP52209 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGDP52209 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGDP52209 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGDP52209 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGDP52209 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PGDP52209 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGDP52209 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGDP52209 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGDP52209 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGDP52209 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGDP52209 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGDP52209 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGDP52209 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGDP52209 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGDP52209 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGDP52209 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGDP52209 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGDP52209 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGDP52209 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGDP52209 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms