Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNT3P45378 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms