Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK1NQ9UHG2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK1NQ9UHG2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms