Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNK4Q9NYG8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNK4Q9NYG8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNK4Q9NYG8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms