Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP9Q5VTM2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms