Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNN3Q15417 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms