Protein–RNA interactions for Protein: Q01543

FLI1, Friend leukemia integration 1 transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLI1Q01543 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FLI1Q01543 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FLI1Q01543 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FLI1Q01543 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FLI1Q01543 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FLI1Q01543 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FLI1Q01543 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FLI1Q01543 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FLI1Q01543 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FLI1Q01543 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FLI1Q01543 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FLI1Q01543 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FLI1Q01543 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FLI1Q01543 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FLI1Q01543 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FLI1Q01543 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FLI1Q01543 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FLI1Q01543 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FLI1Q01543 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FLI1Q01543 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FLI1Q01543 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FLI1Q01543 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FLI1Q01543 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FLI1Q01543 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FLI1Q01543 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FLI1Q01543 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FLI1Q01543 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FLI1Q01543 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FLI1Q01543 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FLI1Q01543 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FLI1Q01543 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FLI1Q01543 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FLI1Q01543 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms