Protein–RNA interactions for Protein: P52815

MRPL12, 39S ribosomal protein L12, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL12P52815 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MRPL12P52815 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL12P52815 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms