Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCEA1P23193 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms