Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCP2P22307 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCP2P22307 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCP2P22307 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCP2P22307 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCP2P22307 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCP2P22307 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCP2P22307 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCP2P22307 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCP2P22307 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCP2P22307 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCP2P22307 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCP2P22307 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCP2P22307 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCP2P22307 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCP2P22307 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SCP2P22307 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCP2P22307 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCP2P22307 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCP2P22307 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCP2P22307 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SCP2P22307 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCP2P22307 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCP2P22307 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCP2P22307 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCP2P22307 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCP2P22307 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCP2P22307 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCP2P22307 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCP2P22307 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCP2P22307 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCP2P22307 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCP2P22307 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCP2P22307 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCP2P22307 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCP2P22307 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCP2P22307 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCP2P22307 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCP2P22307 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCP2P22307 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCP2P22307 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCP2P22307 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCP2P22307 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCP2P22307 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCP2P22307 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCP2P22307 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCP2P22307 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCP2P22307 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCP2P22307 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCP2P22307 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCP2P22307 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCP2P22307 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCP2P22307 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCP2P22307 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCP2P22307 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCP2P22307 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCP2P22307 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCP2P22307 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCP2P22307 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCP2P22307 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCP2P22307 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SCP2P22307 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCP2P22307 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCP2P22307 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCP2P22307 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCP2P22307 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCP2P22307 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCP2P22307 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCP2P22307 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCP2P22307 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCP2P22307 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SCP2P22307 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCP2P22307 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCP2P22307 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCP2P22307 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCP2P22307 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCP2P22307 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCP2P22307 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCP2P22307 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCP2P22307 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCP2P22307 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCP2P22307 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCP2P22307 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCP2P22307 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCP2P22307 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCP2P22307 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCP2P22307 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SCP2P22307 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCP2P22307 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCP2P22307 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCP2P22307 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCP2P22307 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCP2P22307 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCP2P22307 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCP2P22307 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCP2P22307 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCP2P22307 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCP2P22307 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCP2P22307 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCP2P22307 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms