Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC244154.1-201ENST00000620148 1555 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 SFTPA1-203ENST00000428376 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 GGT8P-201ENST00000418938 532 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC234582.2-201ENST00000455788 568 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 TIMP1-201ENST00000218388 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 TIMP1-202ENST00000377017 626 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 LINC00299-203ENST00000444688 537 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 VTI1BP1-201ENST00000486325 700 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CGNL1Q0VF96 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms