RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341115.8

MCOLN3-201, Transcript of mucolipin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MCOLN3, Length 1,762 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3-201ENST00000341115 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.67■■■□□ 2.66
MCOLN3-201ENST00000341115 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.15■■■□□ 2.1
MCOLN3-201ENST00000341115 ABCC9O60706 1549 aa27.65■■■□□ 2.02
MCOLN3-201ENST00000341115 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.63■■□□□ 1.85
MCOLN3-201ENST00000341115 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.61■■□□□ 1.85
MCOLN3-201ENST00000341115 NACADO15069 1562 aa26.57■■□□□ 1.84
MCOLN3-201ENST00000341115 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.4■■□□□ 1.82
MCOLN3-201ENST00000341115 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
MCOLN3-201ENST00000341115 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.24■■□□□ 1.79
MCOLN3-201ENST00000341115 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.87■■□□□ 1.73
MCOLN3-201ENST00000341115 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.8■■□□□ 1.72
MCOLN3-201ENST00000341115 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.68■■□□□ 1.7
MCOLN3-201ENST00000341115 SCRIBQ14160 1630 aa25.65■■□□□ 1.7
MCOLN3-201ENST00000341115 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.58■■□□□ 1.68
MCOLN3-201ENST00000341115 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.43■■□□□ 1.66
MCOLN3-201ENST00000341115 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
MCOLN3-201ENST00000341115 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.98■■□□□ 1.59
MCOLN3-201ENST00000341115 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.89■■□□□ 1.58
MCOLN3-201ENST00000341115 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
MCOLN3-201ENST00000341115 SMARCA4P51532 1647 aa24.55■■□□□ 1.52
MCOLN3-201ENST00000341115 NCAPD3P42695 1498 aa24.53■■□□□ 1.52
MCOLN3-201ENST00000341115 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.49■■□□□ 1.51
MCOLN3-201ENST00000341115 SMARCA2P51531 1590 aa24.49■■□□□ 1.51
MCOLN3-201ENST00000341115 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.36■■□□□ 1.49
MCOLN3-201ENST00000341115 HMGXB3Q12766 1538 aa24.35■■□□□ 1.49
MCOLN3-201ENST00000341115 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.34■■□□□ 1.49
MCOLN3-201ENST00000341115 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
MCOLN3-201ENST00000341115 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
MCOLN3-201ENST00000341115 WIZO95785 1651 aa24.06■■□□□ 1.44
MCOLN3-201ENST00000341115 ERCC6Q03468 1493 aa23.92■■□□□ 1.42
MCOLN3-201ENST00000341115 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
MCOLN3-201ENST00000341115 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.86■■□□□ 1.41
MCOLN3-201ENST00000341115 NESP48681 1621 aa23.86■■□□□ 1.41
MCOLN3-201ENST00000341115 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.84■■□□□ 1.41
MCOLN3-201ENST00000341115 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.8■■□□□ 1.4
MCOLN3-201ENST00000341115 CUX2O14529 1486 aa23.69■■□□□ 1.38
MCOLN3-201ENST00000341115 CFTRP13569 1480 aa23.64■■□□□ 1.37
MCOLN3-201ENST00000341115 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.6■■□□□ 1.37
MCOLN3-201ENST00000341115 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.52■■□□□ 1.36
MCOLN3-201ENST00000341115 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.52■■□□□ 1.36
MCOLN3-201ENST00000341115 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
MCOLN3-201ENST00000341115 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.51■■□□□ 1.35
MCOLN3-201ENST00000341115 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
MCOLN3-201ENST00000341115 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.47■■□□□ 1.35
MCOLN3-201ENST00000341115 WDR62O43379 1518 aa23.36■■□□□ 1.33
MCOLN3-201ENST00000341115 PRDM2Q13029 1718 aa23.32■■□□□ 1.32
MCOLN3-201ENST00000341115 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
MCOLN3-201ENST00000341115 ABCC8Q09428 1581 aa23.21■■□□□ 1.31
MCOLN3-201ENST00000341115 TOPBP1Q92547 1522 aa23.1■■□□□ 1.29
MCOLN3-201ENST00000341115 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.09■■□□□ 1.29
MCOLN3-201ENST00000341115 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.06■■□□□ 1.28
MCOLN3-201ENST00000341115 IFT140Q96RY7 1462 aa23.04■■□□□ 1.28
MCOLN3-201ENST00000341115 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
MCOLN3-201ENST00000341115 SOGA1O94964 1423 aa22.88■■□□□ 1.25
MCOLN3-201ENST00000341115 CUX1P39880 1505 aa22.86■■□□□ 1.25
MCOLN3-201ENST00000341115 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
MCOLN3-201ENST00000341115 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.83■■□□□ 1.25
MCOLN3-201ENST00000341115 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
MCOLN3-201ENST00000341115 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.79■■□□□ 1.24
MCOLN3-201ENST00000341115 OSCARQ8IYS5 282 aa22.78■■□□□ 1.24
MCOLN3-201ENST00000341115 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.24
MCOLN3-201ENST00000341115 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
MCOLN3-201ENST00000341115 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
MCOLN3-201ENST00000341115 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
MCOLN3-201ENST00000341115 WDR97A6NE52 1622 aa22.72■■□□□ 1.23
MCOLN3-201ENST00000341115 TOP2BQ02880 1626 aa22.67■■□□□ 1.22
MCOLN3-201ENST00000341115 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.63■■□□□ 1.21
MCOLN3-201ENST00000341115 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.63■■□□□ 1.21
MCOLN3-201ENST00000341115 GRIN2BQ13224 1484 aa22.61■■□□□ 1.21
MCOLN3-201ENST00000341115 FBLN2P98095 1184 aa22.61■■□□□ 1.21
MCOLN3-201ENST00000341115 SYNJ1O43426 1573 aa22.6■■□□□ 1.21
MCOLN3-201ENST00000341115 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.59■■□□□ 1.21
MCOLN3-201ENST00000341115 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
MCOLN3-201ENST00000341115 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
MCOLN3-201ENST00000341115 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.53■■□□□ 1.2
MCOLN3-201ENST00000341115 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.47■■□□□ 1.19
MCOLN3-201ENST00000341115 SYNJ2O15056 1496 aa22.46■■□□□ 1.19
MCOLN3-201ENST00000341115 CHD1O14646 1710 aa22.42■■□□□ 1.18
MCOLN3-201ENST00000341115 PBRM1Q86U86 1689 aa22.41■■□□□ 1.18
MCOLN3-201ENST00000341115 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.38■■□□□ 1.17
MCOLN3-201ENST00000341115 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.35■■□□□ 1.17
MCOLN3-201ENST00000341115 KIF27Q86VH2 1401 aa22.35■■□□□ 1.17
MCOLN3-201ENST00000341115 TRIM41Q8WV44 630 aa22.28■■□□□ 1.16
MCOLN3-201ENST00000341115 GRIN2AQ12879 1464 aa22.28■■□□□ 1.16
MCOLN3-201ENST00000341115 ADAMTS12P58397 1594 aa22.27■■□□□ 1.16
MCOLN3-201ENST00000341115 ARHGEF11O15085 1522 aa22.27■■□□□ 1.16
MCOLN3-201ENST00000341115 IGF1RP08069 1367 aa22.23■■□□□ 1.15
MCOLN3-201ENST00000341115 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.23■■□□□ 1.15
MCOLN3-201ENST00000341115 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.23■■□□□ 1.15
MCOLN3-201ENST00000341115 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.23■■□□□ 1.15
MCOLN3-201ENST00000341115 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.23■■□□□ 1.15
MCOLN3-201ENST00000341115 NUP160Q12769 1436 aa22.19■■□□□ 1.14
MCOLN3-201ENST00000341115 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.17■■□□□ 1.14
MCOLN3-201ENST00000341115 CUL7Q14999 1698 aa22.13■■□□□ 1.13
MCOLN3-201ENST00000341115 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.13■■□□□ 1.13
MCOLN3-201ENST00000341115 CEP170Q5SW79 1584 aa22.1■■□□□ 1.13
MCOLN3-201ENST00000341115 ARAP1Q96P48 1450 aa22.05■■□□□ 1.12
MCOLN3-201ENST00000341115 JPH4Q96JJ6 628 aa22.05■■□□□ 1.12
MCOLN3-201ENST00000341115 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22■■□□□ 1.11
MCOLN3-201ENST00000341115 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.97■■□□□ 1.11
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