Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 AL590094.1-209ENST00000637260 499 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TRMT13Q9NUP7 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TRMT13Q9NUP7 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TRMT13Q9NUP7 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TRMT13Q9NUP7 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TRMT13Q9NUP7 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TRMT13Q9NUP7 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TRMT13Q9NUP7 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 CHN2-214ENST00000439711 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 AP000343.1-201ENST00000440602 385 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRMT13Q9NUP7 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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