Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ1

PILRA, Paired immunoglobulin-like type 2 receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PILRAQ9UKJ1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PILRAQ9UKJ1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PILRAQ9UKJ1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms