Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL9Q9P2J3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms