Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NRIP3Q9NQ35 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms