Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCA5Q86VQ0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCA5Q86VQ0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCA5Q86VQ0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms