Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNA4P43681 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA4P43681 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms