Protein–RNA interactions for Protein: P01568

IFNA21, Interferon alpha-21, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA21P01568 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IFNA21P01568 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFNA21P01568 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms