Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
E2F1Q01094 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms