Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 TP53I11-220ENST00000533940 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 USP11-204ENST00000377107 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 PEX1-204ENST00000438045 3329 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 TRO-202ENST00000319167 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 TRO-203ENST00000375022 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 RNF170-206ENST00000527424 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 NLRX1-214ENST00000525863 2850 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 DYRK4-214ENST00000543431 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 LAMB3-201ENST00000356082 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 TXNRD1-214ENST00000526691 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 FPGT-202ENST00000370898 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 LIN28A-202ENST00000326279 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CAPZA3Q96KX2 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms