Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.023e-8■■■□□ 18.5
TRA2AQ13595 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.463e-8■■■□□ 18.5
TRA2AQ13595 RTN4-211ENST00000438462 656 ntTSL 511.37□□□□□ -0.593e-8■■■□□ 18.5
TRA2AQ13595 RTN4-206ENST00000394611 4161 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.193e-8■■■□□ 18.5
TRA2AQ13595 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.473e-8■■■□□ 18.5
TRA2AQ13595 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.853e-8■■■□□ 18.5
TRA2AQ13595 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.873e-8■■■□□ 18.5
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TRA2AQ13595 RBBP5-201ENST00000264515 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.21e-7■■■□□ 18.5
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TRA2AQ13595 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.388e-8■■■□□ 17.9
TRA2AQ13595 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.671e-7■■■□□ 17.9
TRA2AQ13595 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.91e-7■■■□□ 17.9
TRA2AQ13595 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.041e-7■■■□□ 17.9
TRA2AQ13595 KTN1-208ENST00000459737 4793 ntTSL 1 (best)2.09□□□□□ -2.081e-7■■■□□ 17.9
TRA2AQ13595 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.131e-7■■■□□ 17.9
TRA2AQ13595 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.151e-7■■■□□ 17.9
TRA2AQ13595 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.161e-7■■■□□ 17.9
TRA2AQ13595 SART3-208ENST00000547528 1935 ntTSL 1 (best)12.19□□□□□ -0.467e-8■■■□□ 17.9
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TRA2AQ13595 SART3-202ENST00000431469 2834 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.847e-8■■■□□ 17.9
TRA2AQ13595 SART3-201ENST00000228284 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.067e-8■■■□□ 17.9
TRA2AQ13595 SART3-204ENST00000546728 3637 ntTSL 1 (best)7.22□□□□□ -1.257e-8■■■□□ 17.9
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TRA2AQ13595 SUPT16H-201ENST00000216297 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.167e-7■■■□□ 17.9
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TRA2AQ13595 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.963e-7■■■□□ 17.8
TRA2AQ13595 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.683e-7■■■□□ 17.8
TRA2AQ13595 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.613e-7■■■□□ 17.8
TRA2AQ13595 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.553e-7■■■□□ 17.8
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