Protein–RNA interactions for Protein: Q01581

HMGCS1, Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCS1Q01581 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGCS1Q01581 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGCS1Q01581 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGCS1Q01581 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMGCS1Q01581 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGCS1Q01581 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGCS1Q01581 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGCS1Q01581 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGCS1Q01581 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGCS1Q01581 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGCS1Q01581 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGCS1Q01581 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGCS1Q01581 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGCS1Q01581 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGCS1Q01581 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGCS1Q01581 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGCS1Q01581 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HMGCS1Q01581 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGCS1Q01581 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGCS1Q01581 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGCS1Q01581 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGCS1Q01581 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGCS1Q01581 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGCS1Q01581 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGCS1Q01581 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGCS1Q01581 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGCS1Q01581 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGCS1Q01581 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGCS1Q01581 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMGCS1Q01581 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HMGCS1Q01581 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMGCS1Q01581 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms