Protein–RNA interactions for Protein: P57103

SLC8A3, Sodium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A3P57103 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC8A3P57103 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC8A3P57103 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms