Protein–RNA interactions for Protein: P26196

DDX6, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX6P26196 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.851e-9■■■■■ 28.9
DDX6P26196 MTF2-214ENST00000545708 4046 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.966e-7■■■■■ 28.9
DDX6P26196 MTF2-213ENST00000540243 3845 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.996e-7■■■■■ 28.9
DDX6P26196 MTF2-201ENST00000370298 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.016e-7■■■■■ 28.9
DDX6P26196 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.164e-7■■■■■ 28.9
DDX6P26196 BRD1-204ENST00000438393 3051 ntTSL 212.96□□□□□ -0.334e-7■■■■■ 28.9
DDX6P26196 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.364e-7■■■■■ 28.9
DDX6P26196 BRD1-203ENST00000404760 4550 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.534e-7■■■■■ 28.9
DDX6P26196 BRD1-202ENST00000404034 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.544e-7■■■■■ 28.9
DDX6P26196 AGAP3-203ENST00000461065 1707 ntTSL 1 (best)16.05■□□□□ 0.164e-9■■■■■ 28.8
DDX6P26196 AGAP3-212ENST00000473633 3751 ntTSL 1 (best)8.91□□□□□ -0.984e-9■■■■■ 28.8
DDX6P26196 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.37e-7■■■■■ 28.8
DDX6P26196 PTPRF-211ENST00000467464 571 ntTSL 312.81□□□□□ -0.367e-7■■■■■ 28.8
DDX6P26196 COX7A2L-207ENST00000482463 1918 ntTSL 211.2□□□□□ -0.623e-8■■■■■ 28.8
DDX6P26196 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.17e-7■■■■■ 28.6
DDX6P26196 ATXN7L3-212ENST00000593073 527 ntTSL 48.58□□□□□ -1.041e-6■■■■■ 28.6
DDX6P26196 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.165e-14■■■■■ 28.6
DDX6P26196 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 02e-6■■■■■ 28.4
DDX6P26196 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.013e-10■■■■■ 28.4
DDX6P26196 TGOLN2-202ENST00000377386 6489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.643e-10■■■■■ 28.4
DDX6P26196 TGOLN2-201ENST00000282120 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.833e-10■■■■■ 28.4
DDX6P26196 CCNY-209ENST00000493157 816 ntTSL 518.22■□□□□ 0.513e-6■■■■■ 28.4
DDX6P26196 CCNY-207ENST00000490012 793 ntTSL 316.7■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 28.4
DDX6P26196 CCNY-208ENST00000492478 809 ntTSL 59.33□□□□□ -0.923e-6■■■■■ 28.4
DDX6P26196 CCNY-206ENST00000470025 346 ntTSL 54.36□□□□□ -1.713e-6■■■■■ 28.4
DDX6P26196 KMT2A-201ENST00000389506 13655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.69e-7■■■■■ 28.4
DDX6P26196 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.099e-7■■■■■ 28.4
DDX6P26196 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.251e-16■■■■■ 28.3
DDX6P26196 BAX-211ENST00000513545 775 ntTSL 323.39■■□□□ 1.333e-12■■■■■ 28.3
DDX6P26196 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 28.3
DDX6P26196 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.282e-6■■■■■ 28.3
DDX6P26196 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.172e-6■■■■■ 28.3
DDX6P26196 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.142e-6■■■■■ 28.3
DDX6P26196 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.455e-6■■■■■ 28.3
DDX6P26196 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.55e-6■■■■■ 28.3
DDX6P26196 NBN-202ENST00000396252 4907 ntTSL 511.1□□□□□ -0.635e-6■■■■■ 28.3
DDX6P26196 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.943e-8■■■■■ 28.2
DDX6P26196 FKBP2-206ENST00000541388 705 ntTSL 520.4■□□□□ 0.863e-8■■■■■ 28.2
DDX6P26196 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.353e-8■■■■■ 28.2
DDX6P26196 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.013e-8■■■■■ 28.2
DDX6P26196 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.126e-7■■■■■ 28.2
DDX6P26196 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.866e-7■■■■■ 28.2
DDX6P26196 NFKBIL1-202ENST00000376146 1411 ntTSL 420.44■□□□□ 0.866e-7■■■■■ 28.2
DDX6P26196 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 28.1
DDX6P26196 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 28.1
DDX6P26196 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 28.1
DDX6P26196 RNF146-202ENST00000356799 2267 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 28.1
DDX6P26196 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.32e-6■■■■■ 28.1
DDX6P26196 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.352e-6■■■■■ 28.1
DDX6P26196 SENP3-EIF4A1-201ENST00000614237 3519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.711e-6■■■■■ 28.1
DDX6P26196 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.641e-9■■■■■ 28.1
DDX6P26196 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.561e-9■■■■■ 28.1
DDX6P26196 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.051e-9■■■■■ 28.1
DDX6P26196 PQLC1-206ENST00000474967 2319 ntTSL 519.01■□□□□ 0.631e-9■■■■■ 28.1
DDX6P26196 PQLC1-201ENST00000351365 2414 ntTSL 217.28■□□□□ 0.361e-9■■■■■ 28.1
DDX6P26196 PQLC1-204ENST00000466449 2887 ntTSL 215.92■□□□□ 0.141e-9■■■■■ 28.1
DDX6P26196 RANBP6-203ENST00000623170 704 ntTSL 413.98□□□□□ -0.171e-9■■■■■ 28.1
DDX6P26196 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.291e-9■■■■■ 28.1
DDX6P26196 RANBP6-202ENST00000485372 1000 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.361e-9■■■■■ 28.1
DDX6P26196 KANK1-202ENST00000382286 2266 ntTSL 212.11□□□□□ -0.472e-18■■■■■ 28.1
DDX6P26196 KANK1-203ENST00000382289 1926 ntTSL 1 (best)11.34□□□□□ -0.592e-18■■■■■ 28.1
DDX6P26196 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.691e-9■■■■■ 28.1
DDX6P26196 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.215e-7■■■■■ 28.1
DDX6P26196 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.498e-8■■■■■ 28
DDX6P26196 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.081e-17■■■■■ 28
DDX6P26196 CALU-201ENST00000249364 3357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.421e-17■■■■■ 28
DDX6P26196 CALU-206ENST00000542996 4225 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.851e-17■■■■■ 28
DDX6P26196 CALU-204ENST00000493278 589 ntTSL 35.22□□□□□ -1.571e-17■■■■■ 28
DDX6P26196 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.33e-6■■■■■ 28
DDX6P26196 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.293e-6■■■■■ 28
DDX6P26196 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 28
DDX6P26196 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 28
DDX6P26196 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.982e-6■■■■■ 28
DDX6P26196 TSPAN14-204ENST00000372157 855 ntTSL 521.05■□□□□ 0.962e-6■■■■■ 28
DDX6P26196 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.922e-6■■■■■ 28
DDX6P26196 B2M-207ENST00000559907 499 ntTSL 315.11■□□□□ 0.019e-15■■■■■ 28
DDX6P26196 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.485e-6■■■■■ 27.9
DDX6P26196 RNF43-207ENST00000583753 3560 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 27.9
DDX6P26196 ALB-203ENST00000415165 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.21e-323■■■■■ 27.8
DDX6P26196 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.411e-323■■■■■ 27.8
DDX6P26196 ALB-208ENST00000495173 445 ntTSL 35.88□□□□□ -1.471e-323■■■■■ 27.8
DDX6P26196 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.471e-323■■■■■ 27.8
DDX6P26196 ALB-205ENST00000476441 1604 ntTSL 55.52□□□□□ -1.531e-323■■■■■ 27.8
DDX6P26196 ALB-216ENST00000511370 1519 ntTSL 55.49□□□□□ -1.531e-323■■■■■ 27.8
DDX6P26196 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.561e-323■■■■■ 27.8
DDX6P26196 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.581e-323■■■■■ 27.8
DDX6P26196 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.661e-323■■■■■ 27.8
DDX6P26196 ALB-213ENST00000508932 369 ntTSL 33.23□□□□□ -1.891e-323■■■■■ 27.8
DDX6P26196 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.255e-6■■■■■ 27.8
DDX6P26196 PKDCC-208ENST00000490302 1447 ntTSL 218.79■□□□□ 0.65e-6■■■■■ 27.8
DDX6P26196 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.364e-6■■■■■ 27.8
DDX6P26196 TRAF2-203ENST00000419057 709 ntTSL 314.89□□□□□ -0.034e-6■■■■■ 27.8
DDX6P26196 TRAF2-204ENST00000429509 823 ntTSL 314.46□□□□□ -0.094e-6■■■■■ 27.8
DDX6P26196 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.162e-9■■■■■ 27.8
DDX6P26196 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.082e-9■■■■■ 27.8
DDX6P26196 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.022e-9■■■■■ 27.8
DDX6P26196 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.172e-9■■■■■ 27.8
DDX6P26196 TET3-202ENST00000409262 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.931e-6■■■■■ 27.8
DDX6P26196 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.352e-6■■■■■ 27.7
DDX6P26196 TSPAN9-206ENST00000537971 4284 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.376e-6■■■■■ 27.7
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