Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00862A6NCI5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00862A6NCI5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LINC00862A6NCI5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LINC00862A6NCI5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms