Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 ARMC9-215ENST00000614261 4975 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 PCDHAC1-201ENST00000253807 5299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 COL8A1-201ENST00000261037 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 MCM3AP-201ENST00000291688 6193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 HYPK-201ENST00000406925 4777 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 PCDHGB2-201ENST00000522605 4602 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 KDM6A-201ENST00000377967 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 KLLN-201ENST00000445946 4277 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 RASAL2-201ENST00000367649 4378 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 AP002360.1-203ENST00000321844 5363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 DPY19L1-201ENST00000310974 4870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 XIRP1-202ENST00000396251 6040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 CEP68-201ENST00000260569 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 ATP2B2-202ENST00000360273 8962 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ERVK-16P61578 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms