Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SCN2BO60939 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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