Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SCN2BO60939 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SCN2BO60939 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SCN2BO60939 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
SCN2BO60939 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SCN2BO60939 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SCN2BO60939 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SCN2BO60939 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SCN2BO60939 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SCN2BO60939 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SCN2BO60939 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCN2BO60939 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SCN2BO60939 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SCN2BO60939 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCN2BO60939 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCN2BO60939 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCN2BO60939 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SCN2BO60939 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCN2BO60939 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCN2BO60939 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCN2BO60939 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SCN2BO60939 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCN2BO60939 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCN2BO60939 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCN2BO60939 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCN2BO60939 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCN2BO60939 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCN2BO60939 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCN2BO60939 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCN2BO60939 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCN2BO60939 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCN2BO60939 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN2BO60939 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCN2BO60939 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN2BO60939 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN2BO60939 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN2BO60939 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCN2BO60939 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCN2BO60939 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCN2BO60939 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCN2BO60939 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCN2BO60939 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCN2BO60939 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCN2BO60939 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SCN2BO60939 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCN2BO60939 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCN2BO60939 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCN2BO60939 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCN2BO60939 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCN2BO60939 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SCN2BO60939 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCN2BO60939 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN2BO60939 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN2BO60939 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCN2BO60939 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCN2BO60939 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN2BO60939 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN2BO60939 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCN2BO60939 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN2BO60939 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCN2BO60939 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCN2BO60939 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCN2BO60939 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SCN2BO60939 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN2BO60939 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCN2BO60939 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCN2BO60939 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCN2BO60939 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN2BO60939 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN2BO60939 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCN2BO60939 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCN2BO60939 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCN2BO60939 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCN2BO60939 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN2BO60939 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCN2BO60939 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCN2BO60939 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN2BO60939 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN2BO60939 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCN2BO60939 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCN2BO60939 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCN2BO60939 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SCN2BO60939 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SCN2BO60939 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCN2BO60939 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SCN2BO60939 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN2BO60939 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN2BO60939 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN2BO60939 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN2BO60939 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN2BO60939 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN2BO60939 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN2BO60939 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCN2BO60939 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN2BO60939 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCN2BO60939 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN2BO60939 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN2BO60939 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN2BO60939 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCN2BO60939 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms